Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "simple sequence repeats" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-2 z 2
Tytuł:
Phylogenetic inference of Ericales based on plastid genomes and implication of cp-SSRs
Autorzy:
Hazra, A.
Das, S.
Bhattacharya, S.
Sur, S
Sengupta, C.
Tematy:
chloroplast genome
Ericales
phylogeny
simple sequence repeats
species tree
Pokaż więcej
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2096423.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
Ericales is an ancient eudicot order encompassing numerous species of economic and ornamental values. Despite several phylogenomic studies, the evolutionary relationship among certain families of this group remains uncertain. The present study assessed a multilocus species tree of Ericales based on 107 chloroplast genomes. The plastome derived microsatellite motifs were also simultaneously explored to check their dynamicity in corroboration of species phylogeny and systematics. In addition to resolving the usual hierarchy, the present phylogenetic analysis enabled to resolve the persisting lineage disparity with valid statistical support. Accordingly, divergence incongruences of Primulaceae, Ebenaceae, and Sapotaceae from earlier reports were reinstated in presently inferred phylogeny, which further supported the latest transcriptome-based relationship of the corresponding group. Various SSR motif characteristics emerged following the recognition of the evolutionary pathway. Numerical variation in tetranucleotide repeats showed even intraspecific or varietal differences in Camellia sinensis. Validation of plastome microsatellite-based polymorphism among the related taxa might pave the way for future phylogenetic and population studies of this economically important group.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Data on the identification of microsatellite markers in Eisenia fetida and Eisenia andrei
Autorzy:
Rorat, Agnieszka
Grzmil, Paweł
Jaskulak, Marta
Pauwels, Maxime
Vandenbulcke, Franck
Płytycz, Barbara
Zorena, Katarzyna
Opis:
Eisenia fetida and Eisenia andrei are closely related earthworm species that play a crucial part in soil and influence its structure and organic matter cycling. Due to their essential environmental role, they are widely used as model organisms in a vast spectrum of research areas. In this work, we partially sequenced genomes of E. fetida and E. andrei, using Illumina technology (Nano 2 × 250 v2 - MiSeq) and de novo assembly strategy. A total of 3785 and 4258 microsatellite or Simple Sequence Repeat (SSR) markers were identified within E. fetida and E. andrei genomic DNA, respectively. The microsatellite markers will facilitate the analyses of genetic diversity and population genetics studies for the two selected earthworm species and their interspecific hybrids.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Artykuł
    Wyświetlanie 1-2 z 2

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies