- Tytuł:
- Klasyfikacja problemów asemblacji i sekwencjonowania peptydów
- Autorzy:
-
Formanowicz, Piotr
Głowacki, Tomasz
Kozak, Adam - Wydawca:
- Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego
- Cytata wydawnicza:
- Kozak, A., Głowacki, T., Formanowicz, P. (2012). Klasyfikacja problemów asemblacji i sekwencjonowania peptydów. W: A. Swierniak, J. Krystek (red.).Automatyzacja Procesów Dyskretnych, Teoria i Zastosowania. Gliwice: Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego.
- Opis:
- Sekwencjonowanie peptydów polega na ustaleniu kolejności aminokwasów (sekwencji) w cząsteczce. Bezpośrednie metody chemii analitycznej pozwalają˛na określenie jedynie krótkich sekwencji. Alternatywa˛dla tych metod jest spektrometria masowa. Widmo masowe powstałe w wyniku przeprowadzenia eksperymentu za pomocą spektrometru wymaga dodatkowej analizy. Z punktu widzenia nauk obliczeniowych analiza takiego widma jest źródłem ciekawych problemów. Ta metoda sekwencjonowania posiada swoje ograniczenia co do długości sekwencji. Rodzi to naturalna˛ potrzebę projektowania metod asemblacyjnych, które pozwolą połączyć wiele krótkich łańcuchów w oryginalna˛cząsteczkę. W pracy tej przedstawiono problemy sekwencjonowania i asemblacji oraz zaproponowano ich klasyfikacje˛. Przedstawiono również wybrane metody rozwiązujące te problemy.
- Dostawca treści:
- Repozytorium Centrum Otwartej Nauki
Artykuł