Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Pedagogiczna Biblioteka Wojewódzka im. Komisji Edukacji Narodowej w Lublinie Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaPedagogiczna Biblioteka Wojewódzka im. Komisji Edukacji Narodowej w Lublinie
Zmień bibliotekę

Wyszukujesz frazę "Formanowicz, Piotr" wg kryterium: Autor

  Lista filtrów
Wyrównaj
    Wyświetlanie 1-8 z 8
    Tytuł:
    Zastosowanie sieci Petriego do modelowania procesów biologicznych
    Applications of Petri nets for modeling of biological processes
    Autorzy:
    Błażewicz, Jacek
    Formanowicz, Dorota
    Formanowicz, Piotr
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1196917.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
    Opis:
    Rapid growth of the amount of available biological data made it clear that an analysis of complex biological processes can be made only with the support of mathematics and computer sciences. It is especially important nowadays when the systems biology approach is becoming more and more widely used in biological science. This new way of investigation of biological phenomena allows, at least in principle, to observe complex relationships between different parts of the analyzed system. These interactions may be crucial for the system's nature and behavior, so observing them may lead to important biological discoveries. Probably the most important part of this process consists in building of a formal model of the biological process. One of the promising methods of such an analysis is based on the theory of Petri nets. Models expressed in the language of this theory are very precise on the one hand, and on the other, they are intuitive, which makes their analysis easier in comparison, for example, to models based on ordinary differential equations. In this paper, a brief introduction to the theory of Petri nets is given and its applications for modeling of some exemplary biological processes are shortly discussed. Moreover, some extensions of the classical Petri nets and their biological applications are also presented.
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Modelowanie udziału żelaza w powstawaniu miażdżycy - podejście systemowe
    Modelling of the iron participation in the development of atherosclerosis - a systemic approach
    Autorzy:
    Formanowicz, Dorota
    Radom, Marcin
    Formanowicz, Piotr
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1191738.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
    Opis:
    Hipotezę zakładającą, że wyższe stężenie żelaza w surowicy odgrywa ważną rolę w rozwoju chorób układu sercowo-naczyniowego zaproponował w 1981 r. J.L. Sullivan. Dziś, wyniki coraz liczniejszych badań potwierdzają istotne znaczenie żelaza w rozwoju miażdżycy. Zasadniczą rolę przypisuje się katalizowanej przez jony tego pierwiastka reakcji Fentona, w następstwie której powstaje silnie toksyczny rodnik hydroksylowy, biorący udział w peroksydacji lipidów. W następstwie wspomnianego procesu powstają zmienione cząsteczki lipidowe, które w sposób nieograniczony wyłapywane są przez komórki jednojądrzaste i stają się komórkami piankowatymi, a potem ciałkami apoptotycznymi tworzącymi blaszkę miażdżycową. W pracy tej przedstawiono systemowe podejście do badania prezentowanego zagadnienia. W tym celu został zbudowany model dotyczący udziału żelaza w powstawaniu miażdżycy oparty na sieciach Petriego. Analiza tego modelu pozwoliła na wyciągnięcie wniosków, iż bez reakcji Fentona, którą katalizuje żelazo, blaszka miażdżycowa nie może powstać.
    The hypothesis that higher serum iron concentration plays an important role in the development of diseases of the cardiovascular system has been proposed in 1981 by J.L. Sullivan. Nowadays, more and more research results confirm importance of iron in the development of atherosclerosis. The essential role plays Fenton reaction catalyzed by ions of this chemical element, which produces highly toxic hydroxyl radical involved in lipids peroxidation. As a result of this process, modified lipid molecules are produced and phagocytosed in unlimited way by mononuclear cells to become foam cells and then apoptotic bodies that form atherosclerotic plaque. In this paper, a systemic approach to the study of these issue is presented. For this purpose, a model based on Petri nets of the iron participation in the development of atherosclerosis has been built. The analysis of this model allowed us to draw the conclusion that without the Fenton reaction, which is catalyzed by iron, atherosclerotic plaque cannot actually arise.
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Klasyfikacja problemów asemblacji i sekwencjonowania peptydów
    Autorzy:
    Formanowicz, Piotr
    Głowacki, Tomasz
    Kozak, Adam
    Wydawca:
    Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego
    Cytata wydawnicza:
    Kozak, A., Głowacki, T., Formanowicz, P. (2012). Klasyfikacja problemów asemblacji i sekwencjonowania peptydów. W: A. Swierniak, J. Krystek (red.).Automatyzacja Procesów Dyskretnych, Teoria i Zastosowania. Gliwice: Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego.
    Opis:
    Sekwencjonowanie peptydów polega na ustaleniu kolejności aminokwasów (sekwencji) w cząsteczce. Bezpośrednie metody chemii analitycznej pozwalają˛na określenie jedynie krótkich sekwencji. Alternatywa˛dla tych metod jest spektrometria masowa. Widmo masowe powstałe w wyniku przeprowadzenia eksperymentu za pomocą spektrometru wymaga dodatkowej analizy. Z punktu widzenia nauk obliczeniowych analiza takiego widma jest źródłem ciekawych problemów. Ta metoda sekwencjonowania posiada swoje ograniczenia co do długości sekwencji. Rodzi to naturalna˛ potrzebę projektowania metod asemblacyjnych, które pozwolą połączyć wiele krótkich łańcuchów w oryginalna˛cząsteczkę. W pracy tej przedstawiono problemy sekwencjonowania i asemblacji oraz zaproponowano ich klasyfikacje˛. Przedstawiono również wybrane metody rozwiązujące te problemy.
    Dostawca treści:
    Repozytorium Centrum Otwartej Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Metody asemblacji długich łańcuchów peptydowych i ich złożoność obliczeniowa
    AUTOMATYZACJA PROCESÓW DYSKRETNYCH
    Autorzy:
    Formanowicz, Piotr
    Głowacki, Tomasz
    Rek, Łukasz
    Kozak, Adam
    Opis:
    Długie peptydy nazywane są białkami i pełnia˛ wiele funkcji w ludzkim organizmie m.in są katalizatorami, transportują inne substancje, chronią przed antygenami. Peptydy zbudowane są z 20 typów aminokwasów połączonych w długie nierozgałęzione łańcuchy (sekwencje). Znajomość sekwencji to pierwszy krok do poznania funkcji białka. Znane metody pozwalają na określenie kolejności aminokwasów (sekwencjonowanie) jedynie krótkich łańuchów. Długie peptydy są częściowo trawione do wielu krótkich sekwencji, które są następnie sekwencjonowane. W dalszej kolejności wykorzystuje się metody asemblacyjne do rekonstrukcji badanego białka. W pracy przedstawiono dwa problemy asemblacji. Zaproponowany został nowy model grafowy jako reprezentacja jednego z tych problemów.
    Dostawca treści:
    Repozytorium Centrum Otwartej Nauki
    Artykuł
    Tytuł:
    Mikromacierze DNA - zasady projektowania sond
    DNA microarray probe design
    Autorzy:
    Formanowicz, Dorota
    Figlerowicz, Marek
    Formanowicz, Piotr
    Urbaniak, Radosław
    Handschuh, Luiza
    Wydawca:
    Committee on Biotechnology PAS
    Komitet Biotechnologii PAN
    Institute of Bioorganic Chemistry PAS
    Instytut Chemii Bioorganicznej PAN
    Powiązania:
    Biotechnologia, vol.83, 4 (2008)-.
    Opis:
    DNA microarrays are widely used in many areas of biological research. They are an efficient tool for gene expression analysis due to a high level of parallelism, what means that they allow for simultaneous measuring of the transcriptional activity of all genes present in the studied genome. The quality of the results obtained using microarrays depends among other factors on the proper design of probes. Two general features which should characterize each probe are sensitivity and specificity. Since designing a set of probes having both of these properties is usually a complex task, many algorithms supporting this process have been developed and implemented. However, the designing method should be carefully chosen such that the results will match the requirements following from the nature of the biological problem to be solved. In this paper the criteria used for DNA microarray design are described and some computer based approaches are presented.
    Dostawca treści:
    RCIN - Repozytorium Cyfrowe Instytutów Naukowych
    Książka
    Tytuł:
    Assembling the SARS-CoV genome - new method based on graph theoretical approach.
    Autorzy:
    Błażewicz, Jacek
    Figlerowicz, Marek
    Formanowicz, Piotr
    Kasprzak, Marta
    Nowierski, Bartosz
    Styszyński, Rafał
    Szajkowski, Łukasz
    Widera, Paweł
    Wiktorczyk, Mariusz
    Tematy:
    algorithm
    assembling
    SARS-CoV
    graphs
    Pokaż więcej
    Wydawca:
    Polskie Towarzystwo Biochemiczne
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/1041512.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
    Opis:
    Nowadays, scientists may learn a lot about the organisms studied just by analyzing their genetic material. This requires the development of methods of reading genomes with high accuracy. It has become clear that the knowledge of the changes occuring within a viral genome is indispensable for effective fighting of the pathogen. A good example is SARS-CoV, which was a cause of death of many people and frightened the entire world with its fast and hard to prevent propagation. Rapid development of sequencing methods, like shotgun sequencing or sequencing by hybridization (SBH), gives scientists a good tool for reading genomes. However, since sequencing methods can read fragments of up to 1000 bp only, methods for sequence assembling are required in order to read whole genomes. In this paper a new assembling method, based on graph theoretical approach, is presented. The method was tested on SARS-CoV and the results were compared to the outcome of other widely known methods.
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
      Wyświetlanie 1-8 z 8

      Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies