Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Pedagogiczna Biblioteka Wojewódzka im. Komisji Edukacji Narodowej w Lublinie Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaPedagogiczna Biblioteka Wojewódzka im. Komisji Edukacji Narodowej w Lublinie
Zmień bibliotekę

Wyszukujesz frazę "Agrobacterium" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Dostawca treści
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-10 z 22
Tytuł:
Studying interactions of Arabidopsis thaliana PCNA1 protein with selected Agrobacterium tumefaciens proteins involved in plant genetic transformation
Badanie interakcji pomiędzy białkiem PCNA1 Arabidopsis thaliana a wybranymi białkami Agrobacterium tumefaciens uczestniczącymi w transformacji genetycznej roślin
Autorzy:
Bednarz, Bartosz
Opis:
Agrobacterium tumefaciens to gatunek bakterii, który wykazuje zdolność do transformacji genetycznej komórek roślinnych, wywołując u roślin dwuliściennych chorobę zwaną guzowatością korzeni. Jest to unikalny w przyrodzie przykład horyzontalnego transferu genów pomiędzy przedstawicielami królestwa bakterii i roślin. W wyniku transformacji, fragment materiału genetycznego Agrobacterium określany jako transformujący DNA (T-DNA), transportowany jest z komórki bakteryjnej do komórki gospodarza, gdzie ulega stabilnej integracji do jej genomu. Efektem genetycznej transformacji komórki roślinnej jest uruchomienie syntezy opin (związków będących dla Agrobacterium źródłem azotu) oraz hormonów przyczyniających się do tumorowacenia tkanki roślinnej.PCNA (ang. proliferating cell nuclear antigen) to konserwowany ewolucyjnie antygen należący do rodziny białek ślizgających się po DNA, występujący w komórkach eukariotycznych: drożdżowych, roślinnych oraz zwierzęcych. Odgrywa on decydującą rolę w złożonym procesie przekazywania informacji genetycznej potomstwu, wymagającym powielenia DNA z zachowaniem poprawności jego sekwencji. Swoją funkcję PCNA pełni poprzez koordynację replikacji DNA oraz procesów jej towarzyszących, takich jak kontrola cyklu komórkowego oraz naprawa uszkodzonej informacji genetycznej.Celem przedstawionej pracy było zbadanie interakcji pomiędzy białkiem PCNA1 Arabidopsis thaliana oraz białkami VirD2 i VirE2 Agrobacterium tumefaciens szczepu C58. Wykazanie powyższych oddziaływań mogłoby wskazywać na zaangażowanie PCNA1 w proces integracji T-DNA do genomu gospodarza. Zaplanowane badania wykonano przy pomocy standardowego dwuhybrydowego systemu drożdżowego ProQuest firmy Invitrogen oraz transmembranowego dwuhybrydowego systemu drożdżowego – Y2H (ang. yeast two-hybrid system) Membrane Protein Kit firmy MoBiTec. Przy pomocy transmembranowego systemu drożdżowego firmy MoBiTec wykazano oddziaływanie pomiędzy PCNA1 i VirD2 oraz PCNA1 i VirE2. Z kolei testy przeprowadzone z wykorzystaniem standardowego dwuhybrydowego systemu drożdżowego firmy Invitrogen nie ujawniły interakcji pomiędzy badanymi białkami.
Agrobacterium tumefaciens is a bacteria species characterised by an ability of genetic transformation of plant cells, causing the crown gall disease in dicotyledonous plants. It is a unique example of an interkingdom horizontal gene transfer between bacteria and plants. As a result of transformation, a fragment of Agrobacterium genetic material, reffered to as the transforming DNA (T-DNA), is transported from the bacterial cell to the host cell and undergoes a stable integration to its genome. Genetic transformation of the plant cell activates the synthesis of opines (compounds being a source of nitrogen for Agrobacterium) and hormones causing growth of tumors within the plant tissue.PCNA (proliferating cell nuclear antigen) is an evolutionarily conserved antigen belonging to the sliding clamp protein family, that has been found in eukaryotic cells: yeast, plant, and animal cells. It plays a crucial role in the complex process of transmission of genetic information to progeny, which requires DNA duplication along with the maintenance of its correct sequence. PCNA accomplishes its role through coordinating both DNA replication and its accompanying processes such as the cell cycle control and DNA repair. The aim of this study was to examine interactions between Arabidopis thaliana PCNA1 protein and Agrobacterium tumefaciens VirD2 and VirE2 proteins. Demonstration of such interactions could suggest an involvement of PCNA1 in the process of T-DNA integration to the host’s genome. Studies were conducted using the standard yeast two-hybrid system – ProQuest from Invitrogen and the transmembrane yeast two-hybrid system - Y2H (yeast-two hybrid system) Membrane Protein Kit from MoBiTec.Using the transmembrane yeast-two hybrid system from MoBiTec, the interactions between PCNA1 and VirD2 and between PCNA1 and VirE2 were detected. On the other hand, the experiments carried out using the yest-two hybrid system from Invitrogen showed that no interactions occur between the studied proteins.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
Tytuł:
Complementation of the A. thaliana insertion strain T-DNA GK-500 E12 using a cDNA encoding cyclin H
Komplementacja linii insercyjnej T-DNA GK-500 E12 A. thaliana cDNA kodującym cyklinę H
Autorzy:
Florek, Joanna
Opis:
Cyclin H is a protein that plays roles such as increasing activity of animal CDK2 (cyclin dependent kinase) or regulation of Arabidopsis stomatal opening. CDK7 forms a trimer with cyclin H and MAT1. CDK7 is CDK-activating kinase (CAK) for CDK1- one of the important kinases regulating cell cycle – and others cyclin-dependent kinases. Plant functional homolog of CDK7 is called CDKD1. CDK7 is also a subunit of transcription factor IIH (TFIIH) and during transcription it phosphorylates C-terminal domain of Rpb1- the largest subunit of pol II RNA. The lack of functional cyclin H is lethal in animals, plant seeds containing insert in cyclin H gene do not sprout and it indicates that not all of its functions are discovered. During that BA dissertation constructs containing cDNA coding cyclin H of Arabidopsis thaliana were used. By flower shoots transformation heterozygous insertion line of A. thaliana (GK-500 E12) with T-DNA insert in cyclin H was transformed by created constructs. In the next step A. thalianas (GK-500 E12) containing expression cassettes with a cDNA of cyclin H were selected.
Cyklina H jest białkiem pełniącym funkcje takie jak zwiększanie aktywności CDK2 (kinazy cyklino-zależnej) u zwierząt czy regulacja otwierania aparatów szparkowych u Arabidopsis. U zwierząt razem z CDK7 i MAT1 tworzy trimer. CDK7 pełni funkcję kinazy aktywującej CDK (CAK) m.in. dla CDK1 – jednej z ważniejszych kinaz dla cyklu komórkowego. U roślin funkcjonalny homolog CDK7 nazwany został CDKD1. CDK7 występuje też jako podjednostka czynnika transkrypcyjnego II H (TFIIH) i w trakcie transkrypcji fosforyluje C-końcową domenę Rpb1 – największej podjednostki polimerazy RNA II. U zwierząt brak funkcjonalnej cykliny H jest letalny natomiast nasiona Arabidopsis ze wstawką T-DNA w genie kodującym cyklinę H nie kiełkują .W trakcie zrealizowanej pracy licencjackiej uzyskano konstrukty ekspresyjne zawierające cDNA cykliny H Arabidopsis thaliana. Za pomocą metody transformacji pędów kwiatowych heterozygotyczną linię insercyjną A. thaliana (GK-500 E12), z kasetą T-DNA w genie kodującym cyklinę H, stransformowano posiadanymi konstruktami genowymi. W kolejnym etapie prac wyselekcjonowano rośliny A. thaliana (GK-500 E12) z wprowadzonymi kasetami ekspresyjnymi zawierającymi cDNA cykliny H.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
Tytuł:
Odyssey of Agrobacterium T-DNA.
Autorzy:
Ziemienowicz, Alicja
Tematy:
Agrobacterium
DNA transfer
T-DNA
virulence
Pokaż więcej
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1044091.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
Agrobacterium tumefaciens, a plant pathogen, is characterized by the unique feature of interkingdom DNA transfer. This soil bacterium is able to transfer a fragment of its DNA, called T-DNA (transferred DNA), to the plant cell where T-DNA is integrated into the plant genome leading to "genetic colonization" of the host. The fate of T-DNA, its processing, transfer and integration, resembles the journey of Odysseus, although our hero returns from its long trip in a slightly modified form.The soil bacterium, Agrobacterium tumefaciens, is a plant pathogen responsible for tumor induction on dicotyledonous plants due to its ability to transfer DNA to the plant cell (reviewed in: de la Cruz & Lanka, 1998; Gelvin, 2000; Hansen & Chilton, 1999; Lartey & Citovsky, 1997; Rossi et al., 1998; Zupan & Zambryski, 1997). In biotechnology this ability is widely used for plant transformation. During tumor induction Agrobacterium attaches to plant cells and then transfers part of its DNA to some of these cells. The transferred DNA (T-DNA) which resides on a large Ti (tumor inducing) plasmid, is processed within the bacterium and is exported to the plant where it becomes integrated into the plant genome (reviewed in: Sheng & Citovsky, 1996; Tinland & Hohn, 1995; Tinland, 1996). Proteins encoded by the virulence (vir) region of the Ti plasmid regulate T-DNA processing and transfer. Phenolic compounds derived from a wounded plant cell wall induce expression of the vir region genes. Virulence proteins recognize 25 bp imperfect direct repeats (border sequences) that define the T-DNA. In the presence of VirD1 protein, VirD2 cleaves the border sequence in a site- and strand-specific manner and subsequently becomes covalently attached to the 5' end of the nicked DNA. The nicked DNA is then displaced from the plasmid producing single-stranded T-DNA. The T-DNA-VirD2 complex and the VirE2 protein are believed to be transferred to the plant through a pilus-like structure containing VirB and VirD4 proteins. In the plant cell, T-DNA becomes coated with the single-stranded DNA-binding protein, VirE2. The T-DNA-protein complex is imported into the nucleus where the T-DNA is integrated into the nuclear genome. Expression of genes located on T-DNA leads to the formation of proteins involved in the production of auxins and cytokinins. These plant hormones cause the tumorous phenotype that is characterized by the ability of the plant cells to proliferate limitlessly and autonomously even in the absence of added phytohormones. Crown gall tumors are characterized by the production of opines (amino-acid derivatives). The biosynthesis of opines is catalyzed by opine synthases, which are encoded by the T-DNA. Opines formed in the tumors can be metabolized by the tumorigenic agrobacteria, but not by most of the other soil organisms. Thus, Agrobacterium creates for itself a favorable niche by genetic modification of plant cells, a process called "genetic colonization". All stages of this colonization, including chemotaxis, attachment, induction of virulence region, processing of T-DNA, T-DNA transfer, T-DNA integration, expression of T-DNA genes and changes in the plant phenotype, will be discussed in the following chapters. This will be an odyssey of T-DNA that leaves the Agrobacterium cell in the form of nucleic acid and returns from its journey in the form of opines, derivatives of amino acids (Fig. 1).
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Production of oleanolic acid glycosides by hairy root established cultures of Calendula officinalis L.
Autorzy:
Długosz, Marek
Wiktorowska, Ewa
Wiśniewska, Anita
Pączkowski, Cezary
Tematy:
Marigold
Agrobacterium rhizogenes
hairy roots
triterpenic saponins
oleanolic acid
transformation
Pokaż więcej
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039552.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
In order to initiate hairy root culture initiation cotyledons and hypocotyls of Calendula officinalis L. were infected with Agrobacterium rhizogenes strain ATCC 15834 or the same strain containing pCAMBIA 1381Z vector with β-glucuronidase reporter gene under control of promoter of NIK (Nematode Induced Kinase) gene. The efficiency of induction of hairy roots reached 33.8% for cotyledons and 66.6% for hypocotyls together for both transformation experiments. Finally, eight control and nine modified lines were established as a long-term culture. The hairy root cultures showed the ability to synthesize oleanolic acid mainly (97%) as glycosides; control lines contained it at the average 8.42 mg · g-1 dry weight in tissue and 0.23 mg · dm-3 in medium; modified lines: 4.59 mg · g-1 for the tissue, and 0.48 mg · dm-3 for the medium. Additionally lines showed high positive correlation between dry/fresh weight and oleanolic acid concentration in tissue. Using the Killiani mixture in acidic hydrolysis of oleanolic acid glycosides released free aglycones that were partially acetylated in such conditions.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Optimization of transient Agrobacterium-mediated gene expression system in leaves of Nicotiana benthamiana
Autorzy:
Wydro, Mateusz
Kozubek, Edward
Lehmann, Przemysław
Tematy:
RNA silencing
Nicotiana benthamiana
viral suppressor
Agrobacterium-mediated transient expression
Pokaż więcej
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1041239.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
Here we report on a simple and reproducible system of Agrobacterium-mediated transient gene expression assay that utilizes infiltration of young Nicotiana benthamiana leaves. Although some of the phenomena described in this paper have been already reported by other researchers, here we have further developed them. The highest level of transient gfp gene expression was detected in the youngest leaves of N. benthamiana infiltrated with A. tumefaciens strains AGL0 and EHA105 precultured in the presence of 450-600 µM acetosyringone. Although the maximum level of transient gfp gene expression was restricted presumably by RNA silencing, it was completely suppressed in the presence of the viral protein HC-Pro. The transient expression system described here can be used to identify new viral suppressors of RNA silencing, for detailed analysis of unidentified genes and for industrial production of proteins in plants as well.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Transformation of wild Solanum species resistant to late blight by using reporter gene gfp and msh2 genes
Autorzy:
Rakosy-Tican, Lenuta
Aurori, Adriana
Aurori, Cristian M.
Ispas, Gabriela
Famelaer, Ivan
Tematy:
Agrobacterium tumefaciens mediated transformation
DNA mismatch repair
gfp
nptII marker gene
Pokaż więcej
Wydawca:
Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/55928632.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
Green fluorescent protein (gfp) reporter gene and nptII marker gene were used to optimize Agrobacterium tumefaciens (agro) mediated transformation of wild Solanum genotypes resistant to late blight. Different genotypes of Solanum bulbocastanum, S. chacoense, S. microdontum and S. verrucosum were assessed for their regeneration ability on MS based media and for agro-mediated transformation. As the first step reporter genes were used to optimize transformation protocol for each species and then the transfer of genes involved in mismatch repair of DNA were attempted in Solanum chacoense. For transformation, either leaf or stem fragments were used. It was shown that gfp is a valuable and elegant tool for monitoring the efficiency of transformation or the occurrence of chimera in all genotypes. Transformation efficiency was dependent on a plant genotype. A number of genotypes have been successfully transformed and they expressed constitutively the bright green fluorescence of gfp without any side effects. The most recalcitrant species proved to be S. microdontum, which did not regenerate plants although different media and phytohormones had been used. The best protocol for S. chacoense transformation was also found to work in the transfer of msh2 genes. Msh2 isolated from Arabidopsis was used and transferred either as mutated (Apa) or antisense (As) gene. The integration of msh2-mutated gene into S. chacoense genome was demonstrated by PCR amplification and confirmed by RT-PCR for some of the putative transgenic clones. The implications of mismatch repair in homologous recombination and its importance for potato improvement are discussed. 
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Wyświetlanie 1-10 z 22

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies