Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "LC-MS/MS" wg kryterium: Temat


Tytuł:
Opracowanie i walidacja metody oznaczania kwasów tłuszczowych z zastosowaniem systemu LC/MS/MS
Development and validation of a method for the determination of fatty acids using LC/MS/MS
Autorzy:
Bator, Karolina
Opis:
The aim of this study was to develop a method for the simultaneous determination of selected thirty-two fatty acids using ultra high performance liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (LC/MS/MS) and to determine the range of linearity for samples prepared in artificial plasma. The subjects of the study were compounds from three families: saturated, monounsaturated and polyunsaturated fatty acids. For purification of the samples the method of protein precipitation with an organic reagent was chosen, using methanol as a precipitating agent. For comparison, purification of samples by liquid-liquid extraction with solvent evaporation under nitrogen atmosphere was also carried out. Optimization of mass detection and chromatographic analysis parameters was carried out. Chromatographic analysis was initially carried out using a mixture of methanol and water with the addition of 1% ammonium acetate as a proton acceptor. Then the mobile phase was changed to a mixture of acetonitrile and water with the addition of 1% ammonium acetate. Chromatographic separation of the studied compounds was performed on an Acquity UPLC BEH C18 column (1.7 µm, 2.1 x 50 mm) using gradient elution. Separation of analytes was achieved in less than four minutes. The retention times of the acids were within a narrow range of 2.46 to 3.36 minutes. The linear dependence of detector response on analyte concentrations was determined according to FDA guidelines. A calibration curve was established for all compounds using samples in the concentration range of 0.625-10.00 µg/ml. Monounsaturated and polyunsaturated fatty acids showed satisfactory linearity, with correlation coefficients in the range 0.9436 - 0.9989. Saturated fatty acids with the exception of nonadecanoic acid did not show linearity, probably due to the mismatched sample purification method. The developed method requires refinement of the sample preparation process and further validation steps to enable its application to the qualitative and quantitative determination of fatty acids in biological samples.
Celem pracy było opracowanie metody jednoczesnego oznaczania wybranych trzydziestu dwóch kwasów tłuszczowych z zastosowaniem ultrasprawnej chromatografii cieczowej sprzężonej z tandemową spektrometrią mas (LC/MS/MS) oraz określenie zakresu liniowości dla próbek sporządzonych w sztucznym osoczu. Przedmiotem badań były związki z trzech rodzin, tj. kwasów tłuszczowych nasyconych, jednonienasyconych oraz wielonienasyconych. Do oczyszczania próbek wybrano metodę strącania białka odczynnikiem organicznym, stosując metanol, jako czynnik strącający. Dla porównania przeprowadzono także oczyszczanie próbek metodą ekstrakcji typu ciecz-ciecz z odparowaniem rozpuszczalnika w atmosferze azotu. Przeprowadzono optymalizację parametrów detekcji masowej oraz analizy chromatograficznej. Analizę chromatograficzną prowadzono początkowo stosując mieszaninę metanolu i wody z dodatkiem 1% roztworu octanu amonu, jako akceptora protonów. Następnie fazę ruchomą zmieniono na mieszaninę acetonitrylu i wody z dodatkiem 1% octanu amonu. Rozdzielenie chromatograficzne badanych związków wykonano na kolumnie Acquity UPLC BEH C18 (1.7 µm, 2.1 x 50 mm) z zastosowaniem elucji gradientowej. Uzyskano rozdzielenie analitów w czasie mniejszym niż cztery minuty. Czasy retencji oznaczanych kwasów mieściły się w wąskim zakresie od 2,46 do 3,36 minut. Liniową zależność odpowiedzi detektora od stężenia analitów wyznaczono według wytycznych FDA. Dla wszystkich związków wyznaczono krzywą kalibracyjną w zakresie stężeń 0,625-10,00 µg/ml. Zadowalającą liniowością charakteryzowały się kwasy jednonienasycone i wielonienasycone, dla których współczynniki korelacji mieściły się w zakresie 0,9436 - 0,9989. Kwasy tłuszczowe nasycone z wyjątkiem kwasu nonadekanowego nie wykazały liniowości, prawdopodobnie z powodu nieodpowiedniej metody oczyszczania próbek. Opracowana metoda wymaga dopracowania procesu przygotowywania próbek oraz przeprowadzenia dalszych etapów walidacji, w celu umożliwienia jej zastosowania do oznaczeń jakościowych i ilościowych kwasów tłuszczowych w próbkach biologicznych.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
Tytuł:
Badanie farmakokinetyki nowego związku ww7/14 o działaniu przeciwpadaczkowym u myszy
Pharmacokinetics of novel compound ww7/14 with anticonvulsant activity in mice
Autorzy:
Pudełko, Damian
Opis:
Celem badań była ocena właściwości farmakokinetycznych nowego związku ww7/14 o działaniu przeciwpadaczkowym u myszy. Substancja ta jest pochodną N-((2,5-dimetylofenoksy)alkilo)aminoalkanoli zsyntetyzowanych i badanych pod kątem działania przeciwdrgawkowego.W ramach przeprowadzonych badań in silico oceniono profil farmakokinetyczny i właściwości biofarmaceutyczne związków ww7/14, ww4/14, A1/14, A2/14 za pomocą programu ADMET Predictor™ (Simulations Plus, Inc.). Wygenerowane parametry pomogły w dogłębnej analizie substancji pod kątem przewidywanych właściwości ADME/T oraz zostały porównane z wytycznymi „reguły pięciu” Lipińskiego. Wszystkie badane analogi mieściły się w wytycznych „reguły pięciu”. Badania uzupełniono o struktury chemiczne potencjalnym metabolitów otrzymanych za pomocą programu Pallas (CompuDrug). Zaobserwowano powstawanie dużej ilości metabolitów, co może być przyczyną znacznego efektu pierwszego przejścia tych substancji w wątrobie lub w ścianie jelita, a w efekcie końcowym niskiej biodostępności badanych analogów.Z uwagi na najsilniejsze działanie hamujące wobec receptorów 5-HT1A, 5-HT2B, oraz hamowanie transportera 5-HT do badań in vivo wybrano związek ww7/14. Opracowano i zwalidowano metodę oznaczania ww7/14 z zastosowaniem systemu LC/MS/MS w osoczu i mózgu myszy, zgodnie z wytycznymi FDA oraz EMA. Granica oznaczalności dla badanego związku we wszystkich matrycach wynosiła 1+-0.2 ng/mL, z kolei granica wykrywalności była równa 0.5 ng/mL.Wszystkie parametry farmakokinetyczne dla badanego związku obliczono techniką bezmodelową za pomocą programu komputerowego Phoenix WinNonlin (Pharsight, Sunnyvale, C.A. USA). Badana substancja cechuje się bardzo niską dostępnością biologiczną, F = 3% po podaniu dożołądkowym oraz F = 7% po podaniu dootrzewnowym. Analiza stężeń związku w tkance mózgowej wykazała dobre przenikanie substancji przez barierę krew-mózg myszy.
The aim of the study was to evaluate the pharmacokinetics of novel antiepileptic compound ww7/14 in mice. This substance is a representative of N-((2,5-dimethylphenoxy)alkyl)aminoalkanol derivatives and has been synthesized and tested for antiepileptic properties.In the first stage of the study, in silico pharmacokinetic and biofarmaceutical profiles of ww7/14, ww4/14, A1/14 and A2/14 have been established, using ADMET Predictor™ (Simulations Plus, Inc.). The generated parameters helped in the in-depth ADME/T properties analysis of compounds and were compared with the guidelines of Lipiński’s ‘rule of five’. All tested compounds resulted in positive score of Lipiński's rule. What is more, in silico study has been supplemented by chemical structures of potential metabolites, which have been obtained using the Pallas (CompuDrug) software. A large amount of metabolites has been observed, which may cause significant first-pass effect of these substances in the liver or intestinal wall and finally result in low bioavailability.Due to the strongest inhibitory effect on 5-HT1A, 5-HT2B and inhibition of 5-HT transporter, compound ww7/14 has been selected for in vivo study. According to the FDA and EMA procedures, bioanalytical method has been developed and validated for the determination of ww7/14, using LC-ESI/MS/MS system in mice’s plasma and brain. The quantitation and detection limits of ww7/14, in all matrices, were respectively 1+-0.2 ng/mL and 0.5 ng/mL.All data in pharmacokinetic experiments were processed with the pharmacokinetics software Phoenix WinNonlin (Pharsight, Sunnyvale, C.A. USA), according to non-compartmental analysis. Compound ww7/14 is characterized by very low bioavailability, which were 3% and 7%, respectively after intragastric and intraperitoneal administration. The concentrations of compound in the brain tissue showed a good penetration through the blood-brain barrier of mice.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
Tytuł:
Badanie metabolizmu nowych związków o właściwościach stabilizujących potencjał błony komórkowej techniką LC/MS/MS
Study of the metabolism of new compounds on the properties of the cell membrane stabilizing potential with the technique LC / MS / MS
Autorzy:
Nowak, Sylwia
Opis:
Celem pracy była identyfikacja metabolitów nowych związków, potencjalnych leków o działaniu stabilizującym błony komórkowe. Badane substancje KM314 oraz KM416 podawano szczurom dożołądkowo w dawkach ED50. W próbkach moczu, krwi oraz narządów wewnętrznych oznaczano potencjalne metabolity badanych związków, wygenerowane wcześniej in silico z zastosowaniem programu komputerowego Pallas. Dla związku KM314 program komputerowy Pallas zaproponował struktury 17 potencjalnych metabolitów mogących powstać w organizmie zwierzęcym w wyniku efektu pierwszego przejścia. Badania in vivo potwierdziły obecność 15 spośród nich, które umownie nazwano: M1, M2, M3, M5, M6, M7, M8, M9, M10, M11, M13, M14, M15, M16, M17. Dla związku KM416 program komputerowy Pallas zaproponował struktury 15 potencjalnych metabolitów mogących powstać w organizmie zwierzęcym w wyniku efektu pierwszego przejścia. Zidentyfikowano 8 spośród 15 potencjalnych metabolitów związku KM416, które umownie nazwano M1, M3, M4, M7, M8, M9, M10, M15.
The aim of this study was the identification of the metabolites of new substances, potential drugs with the activity stabilizing the cell membrane. The studied compounds KM314 and KM416 were administered intragastrically at the dose of ED50. Then in the urine, blood and some tissue were determined potential metabolites of tested substances, which were earlier generated in silico by the Pallas.For the KM314 computer program Pallas made 17 structures of potential metabolites which could be formed in the animal by first pass effect. In vivo research confirmed 13 of them, which were called: M1, M2, M3, M5, M6, M7, M8, M9, M10, M11, M13, M14, M15, M16, M17.For the KM314 computer program Pallas made 15 structures of potential metabolites which could be formed in the animal by first pass effect. In vivo research confirmed 8 of them, which were called: M1, M3, M4, M7, M8, M9, M10, M15.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
Tytuł:
Development of a method for determining xenobiotics in the form of dried blood spots on cotton material and Whatman® 903 cards
Opracowanie metody oznaczania ksenobiotyków w postaci suchych plam krwi na materiale bawełnianym oraz kartach Whatman® 903
Autorzy:
Komajda, Kamila
Przygodzka, Dominika
Tematy:
DBS
bawełna
LC-MS/MS
cotton
Pokaż więcej
Wydawca:
Uniwersytet Jagielloński. Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/59346124.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
Aim of the study: The aim of this study was to develop and validate a quantitative analysis procedure for four benzodiazepines (alprazolam, diazepam, flunitrazepam, clonazepam) and one Z-drug (zolpidem), applied to cotton material and Whatman® 903 cards in the form of blood spots. Material and Methods: The extraction was conducted using a mixture of phosphate-carbonate buffer pH=6, acetonitrile, and methanol. The blood spots were analyzed using high-performance liquid chromatography coupled with triple quadrupole mass spectrometry. Results: All calibration curves maintained linearity (R²>0.995) in the concentration ranges of 1-50 ng/ml on cotton material and Whatman ® 903 cards. The Limit of Detection (LOD) and Limit of Quantitation (LOQ) for the analyzed substances were in the ranges of 0.04- 0.40 ng/ml (LOD) and 0.12-1.08 ng/ml (LOQ) isolated from Whatman® 903 cards, and 0.06-1.15 ng/ml (LOD) and 0.17-2.04 ng/ml (LOQ) isolated from cotton. Accuracy for concentrations of 5 ng/ml, 10 ng/ml, and 50 ng/ml was comparable in both groups, ranging from 76-101% for Whatman® 903 cards and 73-117% for cotton. No significant matrix effect was observed on the quantitative results of the analyzed benzodiazepines. Conclusions: In the presented study, a qualitative and quantitative analysis procedure for four xenobiotics from the benzodiazepine group and zolpidem, applied as dried blood spots on cotton material and Whatman® 903 cards, was developed and validated. The extraction method presented focused on isolating xenobiotics from blood spots of known volume. Sample extraction using a simple liquid-liquid extraction (LLE) technique creates opportunities for applying the described method to real samples secured on cotton material or stored on Whatman® 903 cards.
Cel pracy: Celem niniejszej pracy było opracowanie i zwalidowanie procedury analizy ilościowej dla czterech związków z grupy benzodiazepin (alprazolam, diazepam, flunitrazepam, klonazepam) oraz jednego leku z grupy Z-drugs (zolpidem), naniesionych na materiał bawełniany oraz karty Whatman® 903 w postaci plam krwi. Materiały i metody: Ekstrakcję przeprowadzono przy pomocy mieszaniny buforu fosforanowo-węglanowego ph=6, acetonitrylu i metanolu. Plamy krwi analizowano z wykorzystaniem wysokosprawnej chromatografii cieczowej sprzężonej ze spektrometrią mas typu potrójny kwadrupol. Wyniki: Wszystkie krzywe kalibracyjne zachowały liniowość R2>0,995 w zakresach stężeń 1-50 ng/ml na materiale bawełnianym oraz kartach Whatman® 903. LOD (z ang. Limit of detection) oraz LOQ (z ang. Limit of quantitation) dla analizowanych substancji mieściły się w zakresach: 0,04-0,40 ng/ml (LOD) i 0,12-1,08 ng/ml (LOQ) izolowanych z kart Whatman® 903 oraz 0,06-1,15 ng/ml (LOD) i 0,17-2,04 ng/ ml (LOQ) izolowanych z bawełny. Dokładność dla stężeń 5 ng/ml, 10 ng/ml oraz 50 ng/ml była porównywalna w obu grupach i wynosiła 76-101% dla kart Whatman® 903 oraz 73-117% dla bawełny. Nie wykazano znaczącego wpływu matrycy na ilościowy wynik analizowanych benzodiazepin. Wnioski: W przedstawionym badaniu opracowano oraz zwalidowano procedurę analizy jakościowej oraz ilościowej czterech ksenobiotyków z grupy benzodiazepin oraz zolpidemu, naniesionych, jako suche plamy krwi na materiał bawełniany i karty Whatman® 903. Przedstawiona metoda ekstrakcji skupiała się na izolacji ksenobiotyków z plam krwi o znanej objętości. Ekstrakcja próbek przy pomocy prostej techniki LLE (z ang. Liquid–liquid extraction) stwarza możliwości zastosowania opisanej metody do rzeczywistych próbek zabezpieczonych na materiale bawełnianym lub przechowywanych na kartach Whatman® 903.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Dissipation of methomyl residues in tomato fruits, soil and water using LC-MS/MS
Autorzy:
El-Hefny, D.
Abdallah, I.
Helmy, R.
Mahmoud, H.
Tematy:
dissipation
LC-MS/MS
methomyl
tomato
QuEChERS
Pokaż więcej
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2084623.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
Tomato is an economically important vegetable crop which is attacked heavily by insect pests leading to reduction of yield and quality of the fruits. Field experiments were carried out to investigate the dissipation of methomyl (a common insecticide) used mainly on tomato fruits. LC-MS/MS coupled with the QuEChERS method were used for the determination of methomyl. The results showed that the recovery using matrix-matched standards ranged from 87.8 to 101.3%, with relative standard deviation of 2.5 to 7.5%. Kinetics equation, Log R = log R0 – 0.434 Kt, was used to calculate the rate of degradation in tomato, soil and water. Residue half-life calculated using kinetic rate ranged from 1.95 to 1.63 days in tomato and soil, respectively. From the results it was concluded that tomato fruits can be safely harvested for consumption after 15 days of application based on estimated preharvest interval (PHI). It is advisable to re-estimate the PHI regularly owing to data from the EU and Codex.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
New Rapid Analysis of two Classes of Pesticides in Food Wastewater by Quechers-Liquid Chromatography/Mass Spectrometry
Autorzy:
Łozowicka, B.
Kaczyński, P.
Szabuńko, J.
Ignatowicz, K.
Warentowicz, D.
Łozowicki, J.
Tematy:
wastewater
azole
neonicotinoids
QuEChERS
LC-MS/MS
Pokaż więcej
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Inżynierii Ekologicznej
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/123585.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
The rapid analytical method was developed in response to increasing concern over the environmental impact of azoles (sterol biosynthesis inhibitors) and neonicotinoids (nicotinic acetylcholine receptor site). These chemicals are commonly used to protect fruit and vegetables crops against fungi and pests. Seven insecticides and twenty one fungicides commonly occurring in food industrial wastewater have been determined. For this purpose, active substances from two new pesticide classes were extracted and isolated by QuEChERS by addition of acetonitrile, buffering salts and chitin as a clean-up sorbent. The novelty of this procedure was one step sample preparation including extraction and removing of co-extracts in short time. Instrumental analysis was conducted by liquid chromatography coupled with mass spectrometry using multiple reaction monitoring. The limits of detection ranged from 0.002 to 0.005 μg·L-1 with satisfactory accuracy and precision The recoveries for the pesticides ranged from 81–103%, with high repeatability (n = 3, RSD ≤ 9%) and low LOQs (0.01 μg·L-1). Matrix effects calculated were less than 12% for all analyses. The method was applied to routine analysis of food industrial wastewater. Concerning the results, total pesticide levels in most cases were below 1 μg·L -1. The most significant pesticides in terms of concentration and frequency of detection were acetamiprid (0.07 μg· L-1); tebuconazole (1.2 μg· L-1) and thiacloprid (0.04 μg·L-1).
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Development of an LC-MS/MS method for the determination of memantine using the dried blood spots technique
Opracowanie metody LC-MS/MS oznaczania memantyny z zastosowaniem techniki suchej plamki krwi
Autorzy:
Czereba, Sylwia
Opis:
Memantyna (MEM) jest lekiem zarejestrowanym w terapii otępienia, zwłaszcza w przebiegu choroby Alzheimera. Dodatkowo wykazuje potencjał w leczeniu schorzeń neurodegeneracyjnych i neuropsychiatrycznych, co zwiększa liczbę badań nad tym lekiem. W ostatnich latach dużą uwagę zwraca się na technikę suchej plamki krwi (DBS), która rozwija się zwłaszcza w zakresie terapeutycznego monitorowania leków, a także w badaniach nad farmakokinetyką i farmakodynamiką leków i nowych związków. Głównymi zaletami DBS jest nieinwazyjny sposób pobrania materiału, niewielka wymagana objętość krwi, a także łatwość przechowywania i transportu. Celem niniejszej pracy było opracowanie, wstępna walidacja i ocena przydatności techniki DBS w oznaczeniach stężenia MEM w krwi szczurzej z wykorzystaniem LC-MS/MS. Wysoka specyficzność metody LC-MS/MS oraz możliwość ilościowego oznaczania analitów w próbkach wieloskładnikowych, przemawia za jej użyciem do oznaczania MEM. Parametry LC i MS zostały zoptymalizowane pozwalając na uzyskanie smukłych i symetrycznych pików dla MEM z czasem retencji powyżej 4 minut. Ustalono także zoptymalizowaną procedurę ekstrakcji leku z kart QIAcard przy użyciu metanolu. Przeprowadzono częściową walidację metody, sprawdzając liniowość, precyzję i dokładność oznaczeń MEM w metanolu i osoczu. Wyniki wstępnej walidacji LC-MS/MS wskazują na jej przydatność w oznaczeniach MEM. Co więcej przeprowadzone badanie wydajności ekstrakcji leku z kart QIAcard w oparciu o stosunek średnich pól powierzchni pod pikiem po ekstrakcji z DBS i z pełnej krwi szczurzej równy 0,97 wskazuje na potencjał techniki DBS w oznaczeniach MEM. Potwierdzenie tej tezy wymaga jednak przeprowadzenia pełnej walidacji metody.
Memantine (MEM) is registered for the treatment of dementia, particularly in Alzheimer’s disease. Additionally, it shows potential in the treatment of neurodegenerative and neuropsychiatric disorders, which increases the number of studies on this drug. Recently, much attention has been paid to the dry blood spot (DBS) technique, which is developing especially in the field of therapeutic drug monitoring, as well as in studies on pharmacokinetics and pharmacodynamics. The main advantages of DBS are the non-invasive method of sampling, small volume of required blood, as well as ease of storage and transport. The purpose of this study was to develop, preliminary validate and evaluate the utility of the DBS technique in determining the concentration of MEM in rat blood using LC-MS/MS. The high specificity of the LC-MS/MS method and the possibility of quantitative determination of analytes in complex samples, argues for its use as suitable for determining MEM. LC and MS parameters were optimized, allowing to obtain sharp and symmetrical peaks for MEM with retention time over 4 min. An optimized extraction procedure of the drug from QIAcards using methanol was established. Partial validation of the method was performed, checking the linearity, precision, and accuracy. The results of the validation indicate its utility in MEM determination. Moreover, the extraction efficiency study of the drug from QIAcard, based on the ratio of the average peak areas equal to 0.97, indicates the potential of the DBS technique in MEM determination. However, confirmation of this thesis would require a full validation of the method.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
Tytuł:
Opracowanie i walidacja metody oznaczania wybranych leków stosowanych w leczeniu nadciśnienia tętniczego z zastosowaniem techniki LC/MS/MS
Development and validation of method for determination of selected drugs used to treat arterial hypertension using LC/MS/MS.
Autorzy:
Ciupka, Magdalena
Opis:
The aim of this study was to develop and validate simultaneous quantitative and qualitative determination of fifteen drugs in human plasama used to treat hypertension (amiodarone, bisoprolol, digoxin, eplerenone, furosemide, ivabradine, carvedilol, lisinopril, metoprolol, nebivolol, perindopril, ramipril, spironolactone, torasemide, zofenopril). At the beginning plasma samples were precipitated or extracted. Afterwards analysis was performed using high performance liquid chromatography with tandem mass spectroscopy combined with electrospray ionization (LC-ESI/MS/MS). The developed method corresponds to the validation criteria of bioanalytical methods made by FDA and EMA. Performed method was characterized by high sensitivity, enabling the determination of selected drugs in human plasma. The precision of the method for the tested compounds was lower than 15 % and the accuracy was within 85-115 %. For all drugs the linearity in wide range of concentration was obtained and the coefficient of correlation was higher than 0.99. The developed method was used to determine the concentration of drugs tested in the context of therapeutic drug monitoring. In a plasma collected from six patients diagnosed with resistant hypertension were identified and determined concentration of the three drugs such as amiodarone, furosemide and ramipril.
Celem pracy było opracowanie i walidacja metody jednoczesnego oznaczania wybranych leków stosowanych w leczeniu nadciśnienia tętniczego (amiodaron, bisoprolol, digoksyna, eplerenon, furosemid, iwabradyna, karwedilol, lisinopril, metoprolol, nebiwolol, perindopril, ramipril, spironolakton, torasemid, zofenopril) w osoczu ludzkim. Oznaczenia prowadzono z zastosowaniem wysokosprawnej chromatografii cieczowej sprzężonej z tandemową spektrometrią mas z jonizacją typu elektrorozpylania (LC-ESI/MS/MS) po uprzednim przygotowaniu próbek osocza przez strącenie lub ekstrakcję. Opracowana metoda spełnia kryteria walidacji opracowane przez FDA i EMA dla metod bioanalitycznych. Opracowana metoda cechowała się wysoką czułością, umożliwiając oznaczenia wybranych leków w osoczu ludzkim. Precyzja metody dla badanych związków była niższa od 15%, a dokładność mieściła się w granicach 85 115%. Dla badanych leków uzyskano liniowość w szerokim zakresie stężeń, a współczynnik korelacji był wyższy od 0.99.Opracowaną metodę zastosowano do oznaczenia stężenia badanych leków w ramach terapii pod kontrolą stężenia leku we krwi. W osoczu pobranym od sześciu chorych, u których zdiagnozowano oporne nadciśnienie tętnicze zidentyfikowano oraz oznaczono stężenie trzech leków, takich jak amiodaron, furosemid i ramipril.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
Tytuł:
Identification of O-GlcNAcylated proteins in melanoma. Mapping of glycosylation sites
Identyfikacja O-GlcNAcylowanych białek w czerniaku. Mapowanie miejsc glikozylacji
Autorzy:
Kaczmarczyk, Katarzyna
Opis:
Czerniak wywodzi się ze zmienionych nowotworowo komórek barwnikowych. Choroba jest często diagnozowana w fazie przerzutu, stąd wysoka śmiertelność pacjentów. O-GlcNAcylacja to potranslacyjna modyfikacja białek, polegająca na dołączeniu pojedynczej reszty β-N-acetyloglukozaminy (GlcNAc) wiązaniem O-glikozydowym do seryny lub treoniny. Proces ten ma charakter dynamiczny i odwracalny, a podlegają mu białka wewnątrzkomórkowe: mitochondrialne, jądrowe oraz cytozolowe. W regulację cyklu O-GlcNAcylacji zaangażowane są dwa enzymy: O-GlcNAc transferaza (OGT), która katalizuje reakcję przyłączania reszt N-acetyloglukozaminy oraz β-N-acetyloglukozaminidaza (OGA), która odpowiada za usunięcie reszt GlcNAc. Białka O-GlcNAcylowane pełnią wiele istotnych funkcji w komórce jak np. regulacja cyklu komórkowego, przekazywanie sygnału, transkrypcje, translacje czy odpowiedź na stres komórkowy. Zaburzenia poziomu O-GlcNAcylacji białek obserwuje się w niektórych stanach patologicznych, takich jak cukrzyca, choroby neurodegeneracyjne czy nowotworzenie. Zmiany w poziomie O-GlcNAcylacji białek mogą mieć wpływ na proliferacje, angiogenezę, metastazę i inwazję komórek nowotworowych oraz pośrednio wpływać na wiele czynników istotnych w powstawaniu i rozwoju nowotworu. Praca przedstawia próbę identyfikacji białek O-GlcNAcylowanych oraz miejsc glikozylacji w komórkach czerniaka metastatycznej linii WM226-4. W tym celu białka ekstraktu komórkowego poddano trypsynizacji, następnie immunoprecypitacji przeciwciałami rozpoznającymi resztę O-GlcNAc. O- GlcNAcylowane peptydy tryptyczne badano metodą tandemowej spektrometrii mas sprzężonej z chromatografią cieczową, a otrzymane wyniki analizowano przy użyciu technik bioinformatycznych. Zidentyfikowano 129 (w tym 77 nowych) białek ulegających O-GlcNAcylacji oraz jednoznacznie zmapowano 45 miejsc przyłączenia reszty GlcNAc. Wśród nich można wyróżnić wiele białek ważnych dla procesu nowotworzenia w tym białka szlaków energetycznych, białka uczestniczące w metabolizmie, białka biorące udział w ich fałdowaniu, składniki cytoszkieletu, chaperony oraz czynniki transkrypcyjne. Co ważne wg bazy dbDEPC 3.0, około 30% genów dla zidentyfikowanych białek wykazuje zmienną ekspresję w czerniaku, co sugeruje, że są one istotne w progresji tego nowotworu.
Melanoma is derived from cancer-transformed pigment cells. The disease is often diagnosed in the metastatic phase, hence the high mortality of patients. O-GlcNAcylation is a post-translational modification of proteins involving the addition of a single β-N-acetylglucosamine (GlcNAc) residue by an O-glycosidic linkage to serine or threonine. This process is dynamic and reversible, and it is subject to intracellular proteins: mitochondrial, nuclear and cytosolic. Two enzymes are involved in regulation of the O-GlcNAcylation cycle: O-GlcNAc transferase (OGT), which catalyzes the attachment of N-acetylglucosamine residues and β-N-acetylglucosaminidase (OGA), which is responsible for the removal of GlcNAc residues. O-GlcNAcylated proteins play many important functions in the cell, such as cell cycle regulation, signal transduction, transcription, translation or response to cellular stress. Protein O-GlcNA protein abnormalities are observed in some disease, such as diabetes, neurodegenerative diseases or cancer. Changes in the O-GlcNAcylation level of proteins may have an effect on proliferation, angiogenesis, metastasis and invasion of cancer cells, and indirectly affect many factors important in the formation and development of cancer. This paper presents an attempt to identify O-GlcNAcylated proteins and glycosylation sites in WM226-4 metastatic melanoma cells. To this aim, the cell extract proteins were trypsinized, followed by immunoprecipitation with antibodies recognizing the O-GlcNAc residue. O-GlcNAcillated tryptic peptides were analyzed by tandem liquid chromatography-mass spectrometry and the obtained results were analyzed using bioinformatics techniques. 129 (including 77 new) O-GlcNAcylation proteins were identified and 45 sites of the GlcNAc residue attachment were clearly mapped. Among them, there are many proteins important for the neoplastic process, including energy pathway proteins, proteins participate in metabolism, proteins involved in their folding, cytoskeletal components, chaperones and transcription factors. Importantly, according to dbDEPC 3.0, about 30% of genes for identified proteins show variable expression in melanoma, which suggests that they are important in the progression of this cancer.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies