Temat: dolichol - Prolib Integro

Skocz do pozycji: 1.

Tytuł:: Dolichols of the fern Matteucia struthiopteris.
Autorzy:: Wojtas, Magdalena
Bieńkowski, Tomasz
Zelman-Femiak, Monika
Tateyama, Seiji
Sagami, Hiroshi
Chojnacki, Tadeusz
Danikiewicz, Witold
Swiezewska, Ewa
Tematy:: polyisoprenoid
dolichol
electrospray mass spectrometry
Matteucia struthiopteris
kogomi
Polypodiaceae; Pokaż więcej
Wydawca:: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/1041485.pdf Link otwiera się w nowym oknie
Opis:: Dolichols isolated from leaves of the fern Matteucia struthiopteris were present as a mixture of prenologues composed of 14 up to 20 isoprene units with Dol-16 dominating. They comprised approximately 0.004% of the fresh weight of fresh plant tissue and were accompanied by traces of polyprenols (Pren-14 up to Pren-17, Pren-16 dominating). Their structure was confirmed by electropray ionization mass spectrometry (ESI-MS). This is the first time that dolichols have been reported as dominating polyisoprenoid alcohols in plant photosynthetic tissue.
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Skocz do pozycji: 2.

Tytuł:: Distribution, occurrence, and cluster analysis of new polyprenyl acetones and other polyisoprenoids from North Sumatran mangroves
Autorzy:: Basyuni, Mohammad
Sagami, Hiroshi
Baba, Shigeyuki
Oku, Hirosuke
Tematy:: chemotaxonomic marker
dolichol
indonesian mangroves
polyprenol
two-dimensional thin
layer chromatography; Pokaż więcej
Wydawca:: Polska Akademia Nauk. Instytut Dendrologii PAN
Powiązania:: https://bibliotekanauki.pl/articles/956820.pdf Link otwiera się w nowym oknie
Opis:: Background. Mangrove forests have long been known as a source of phytochemical compounds producing various secondary metabolites. Despite the ubiquitous diversity of polyisoprenoids in the plant kingdom, few studies have focused on the distribution of polyisoprenoids in mangrove plants. The present study describes the distribution and occurrence of a new class of prenyl derivates – polyprenyl acetone as well as other polyisoprenoids in fourteen species of Indonesian mangroves, with an emphasis on chemotaxonomic importance. Material and methods. The leaves and roots of fourteen North Sumatran mangroves were analyzed using two-dimensional thin layer chromatography and electrospray ionization mass spectrometry. Results. In the leaves, the distribution of several types of polyprenyl acetones, polyprenols, and dolichols was detected and classified into types: type-I, having a predominance of dolichols over polyprenols (more than nine-fold), was observed in Acrostichum aureum (younger leaves), Avicennia alba, Av. lanata, Av. officinalis, Bruguiera parviflora, Ceriops tagal, Nypa fruticans, and Rhizophora mucronata; type-II, having the presence of both polyprenols and dolichols, was observed in Acanthus ilicifolius, Acr. aureum, B. cylindrica, and R. apiculata; type-III having a predominance of polyprenols over dolichols (more than nine-fold), was not observed in any North Sumatran mangroves; type-IV, having the presence of both polyprenyl acetones and dolichols, was observed in Aegiceras corniculatum; type-V, having the presence of polyprenyl acetones, polyprenols, and dolichols, was observed in Sonneratia caseolaris and Xylocarpus granatum. In the roots, type-I distribution was observed in Ae. corniculatum, Av. alba, Av. lanata, Av. officinalis, B. parviflora, C. tagal, N. fruticans, R. apiculata, R. mucronata, S. caseolaris, and X. granatum. Type-II distribution was observed in Ac. ilicifolius, Acr. aureum, and B. cylindrica. Type-III, -IV, and -V distributions were not observed in mangrove roots. Cluster analysis demonstrated that polyisoprenoid patterns in the leaves and roots form distinct separation into appropriate genera and tribe, suggesting that mangrove polyisoprenoids are chemotaxonomically significant. Conclusions. The major polyisoprenoid alcohols in Indonesian mangroves were found to be dolichols rather than polyprenols. The diversity of polyisoprenoids in both leaves and roots of mangroves may provide chemotaxonomic marker. The discovery of a new class of polyprenyl acetone is the first report from mangrove plants.
Dostawca treści:: Biblioteka Nauki

Artykuł

na półce

Skocz do pozycji: 3.

Tytuł:: Regulacja procesu glikozylacji białek przez kaskadę cAMP.
cAMP signaling cascade in regulation of protein glycosylation
Autorzy:: Surman, Magdalena
Opis:: Glikozylacja jest jedną z najczęstszych i najbardziej złożonych potranslacyjnych modyfikacji białek. Rosnące znaczenie glikobiologii dla wiedzy z zakresu nauk o życiu wynika z faktu, że przyłączanie reszt cukrowych do łańcuchów białkowych jest źródłem różnorodności proteomu, w znacznie większym stopniu niż inne jego modyfikacje. Prawie każdy efekt procesu glikozylacji – kompozycja łańcucha cukrowego, jego struktura czy długość – może być bowiem modyfikowany poprzez serię, złożonych reakcji enzymatycznych, w które zaangażowane są glikozylotransferazy i glikozydazy. W związku z jej licznymi funkcjami w komórce, glikozylacja jest kluczowa dla szerokiego spektrum procesów biologicznych, począwszy od adhezji komórek do macierzy zewnątrzkomórkowej, po interakcje białko-ligand. Opublikowane na przestrzeni ostatnich dekad oryginalne prace naukowe oraz prace przeglądowe dokładnie analizowały prawie każdy aspekt procesu glikozylacji. W poniższej pracy w sposób przekrojowy opisano proces glikozylacji oraz scharakteryzowano szlak sygnalizacji komórkowej wykorzystujący cykliczny adenozyno-3’,5’-monofosforan (cAMP). Zgromadzone dane pozwalają postawić tezę, że stężenie cAMP w komórce może regulować proces glikozylacji białek poprzez aktywację kluczowej glikozylotransferazy – syntazy mannozylofosfodolicholu (DPMS, z ang. dolichol phosphate mannose synthase) na drodze fosforylacji/defosforylacji zależnej od kinazy białkowej A (PKA, z ang. protein kinase A). DPMS jest zaangażowany w procesie syntezy prekursorowych oligosacharydów związanych z lipidowym nośnikiem – fosforanem dolicholu (LLOs, z ang. lipid-linked oligosaccharides), będących donorami glikanów przyłączanych wiązaniami glikozydowym do łańcuchów białkowych. Te interesujące obserwacje stanowią krok ku zrozumieniu fundamentalnych czynników wpływają na biosyntezę łańcuchów cukrowych na samym początku. Fizjologiczne i medyczne implikacje tego mechanizmu regulacji i jego rola w rozwoju chorób związanych z zaburzeniami glikozylacji powinny stać przedmiotem przyszłych badań naukowych.
The glycosylation is one of the most common and complex of the post-translational modifications (PTMs). The contribution of glycobiology to life Science is being increasingly recognised as the attachment of sugar moieties to proteins expands proteomic diversity to a level unmatched by any other PTM. The cell is able to facilitate this diversity, because almost every aspect of glycosylation, such as the glycan composition, structure or length, can be modified by a series of complex enzymatic reactions involving the glycosyltransferases and the glycosidases. Due to its multiple functions in the cell, the glycosylation is critical for a wide range of biological processes from the cell attachment to the extracellular matrix, to the protein-ligand interactions. Recently, a number of the original papers and the reviews on different aspects of glycoprotein biology have appeared. In this thesis, an overview of protein glycosylation is provided, followed by a description of the cyclic AMP (cAMP) signalling pathway that has been studied with respect to the regulation of glycosylation. The collected research data strongly suggest that the cAMP levels in the cell may modulate protein glycosylation by activation of crucial glycosyltransferase – dolichol phosphate mannose synthase (DPMS), through a cAMP-dependent protein kinase-mediated protein phosphorylation/dephosphorylation cycle. The DPMS is involved in the synthesis of lipid-linked oligosaccharides (LLOs) which are carbohydrate-dolichol lipid intermediates that deliver preassembled carbohydrate core to form a glycosidic linkage with protein chain. These interesting observations are a step toward the understanding of fundamental factors that alter the glycan chains biosynthesis at the very beginning. Physiological and medical implication of this regulatory mechanism and its role in development glycosylation disorders should be the subjects of the future research.
Dostawca treści:: Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego

Inne

na półce

Skocz do pozycji: 4.

Tytuł:: Analiza porównawcza oligosacharydów związanych z dolicholem i białkiem w melanocytach i komórkach czerniaka
Comparative analysis of dolichol- and protein-linked oligosaccharides in melanocytes and melanoma cells
Autorzy:: Wisz, Karolina
Opis:: Changes in the pattern of protein glycosylation during oncogenic transformation result in the emergence of diagnostic and prognostic markers of disease progression. The aim of this study was to determine and compare the N-glycosylation profile of proteins in melanocytes and melanoma cells, as well as to check if differences in glycosylation appear at an early stage of oligosaccharides synthesis on dolichol-phosphate. The study was performed on two human cell lines HEMa-LP (melanocytes) and WM266-4 (metastatic skin melanoma). N-glycans released from dolichol-phosphate (LLO) and proteins (NLO) were analyzed in terms of their structure using high performance liquid chromatography based on hydrophilic interactions (HILIC HPLC) with simultaneous exoglycosidase sequencing digestion of oligosaccharides. In addition, desialylated N-glycans released from protein were analysed by mass spectrometry (MALDI-MS). It was observed that the oligosaccharide fraction released from dolichol consisted mainly of the mature N-glycan precursor (Glc3Man9GlcNAc2) in both melanocytes and metastatic melanoma cells. The results obtained for intermediate structures were inconclusive, and therefore it was impossible to determine the differences in glycosylation between melanocytes and metastatic melanoma cells at the stage of oligosaccharide synthesis on dolichol-phosphate. It was found that N-glycans released from glycoproteins contained in melanocytes were most frequently represented by oligomannose structures, whereas among complex N-glycans the most common were biantennary structures. Metastatic melanoma cells have fewer oligomannose oligosaccharides compared to melanocytes, whereas complex N-glycans were most represented by β1-4-branched triantennary structures. Among the N-glycans released from proteins of the WM266-4 cell line, structures containing β1-3-linked galactose constituted a large proportion. It was found that metastatic melanoma cells have a higher proportion of α2-6 linked sialic acid compared to melanocytes. The comprehensive analysis of N-glycans released from the total pool of glycoproteins present in melanocytes and metastatic melanoma cells discussed in this master's thesis shows changes in protein glycosylation during the transformation into metastatic melanoma. These changes turned out to be mainly quantitative, so further research is needed to improve the methods of assessing the content of individual N- glycans, as well as precisely determining the profile of N-glycans in different stages of melanoma development, in order to determine markers of cancer progression.
Podczas transformacji nowotworowej obserwuje się zmiany we wzorze glikozylacji białek, które mogą stanowić markery diagnostyczne oraz prognostyczne postępu choroby. Celem niniejszej pracy było określenie i porównanie profilu N- glikozylacji białek w melanocytach oraz komórkach czerniaka, a także sprawdzenie czy różnice w glikozylacji pojawiają się już na wczesnym etapie syntezy oligosacharydów na fosfodolicholu. Badanie zostało przeprowadzone na dwóch ludzkich liniach komórkowych HEMa-LP (melanocyty) oraz WM266-4 (metastatyczny czerniak skóry). N-glikany uwolnione z fosfodolicholu (LLO) oraz białka (NLO) zostały przeanalizowane pod względem ich budowy strukturalnej z zastosowaniem wysokosprawnej chromatografii cieczowej opartej o oddziaływania hydrofilowe (HILIC HPLC) z równoczesnym sekwencyjnym trawieniem oligosacharydów zestawami egzoglikozydaz. Dodatkowo desjalowane N-glikany uwolnione z białka zostały przeanalizowane za pomocą spektrometrii mas (MALDI-MS). Wykazano, że frakcja oligosacharydów uwolnionych z dolicholu składała się głównie z dojrzałego prekursora N-glikanów (Glc3Man9GlcNAc2) zarówno w melanocytach jak i metastatycznych komórkach czerniaka. Wyniki uzyskane dla struktur pośrednich były niejednoznaczne, w związku z czym niemożliwe było określenie różnic w glikozylacji między melanocytami, a metastatycznymi komórkami czerniaka na etapie syntezy oligosacharydów na fosfodolicholu. Stwierdzono, że N-glikany uwolnione z glikoprotein zawartych w melanocytach były najliczniej reprezentowane przez struktury wielomannozowe, natomiast spośród Nglikanów kompleksowych najczęstsze były struktury dwuantenowe. Metastatyczne komórki czerniaka posiadały mniejszą ilość oligosacharydów wielomannozowych w porównaniu do melanocytów, natomiast N-glikany kompleksowe były najliczniej reprezentowane przez struktury trzyantenowe rozgałęzione β1-4. Wśród N-glikanów uwolnionych z białek linii komórkowej WM266-4 duży udział stanowiły struktury zawierające w swoim składzie β1-3 związaną galaktozę. Stwierdzono, że metastatyczne komórki czerniaka posiadają większy udział kwasów sjalowych przyłączonych do N- glikanów wiązaniem α2-6 w porównaniu do melanocytów. Przedstawiona w niniejszej pracy magisterskiej kompleksowa analiza N-glikanów uwolnionych z całkowitej puli glikoprotein obecnych w melanocytach oraz metastatycznych komórkach czerniaka prezentuje zmiany w glikozylacji białek podczas transformacji nowotworowej w przerzutowego czerniaka. Zmiany te okazały się głównie ilościowe, w związku z czym konieczne są dalsze badania w kierunku doskonalenia metod oceny zawartości poszczególnych N-glikanów, a także precyzyjnie określających profil N-glikanów na poszczególnych stadiach rozwoju czerniaka, w celu ustalenia markerów postępu nowotworu.
Dostawca treści:: Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego

Inne

na półce

Informacja

Wyszukujesz frazę "dolichol" wg kryterium: Temat