Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Pedagogiczna Biblioteka Wojewódzka im. Komisji Edukacji Narodowej w Lublinie Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaPedagogiczna Biblioteka Wojewódzka im. Komisji Edukacji Narodowej w Lublinie
Zmień bibliotekę

Wyszukujesz frazę "gene identification" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Dostawca treści
Wyrównaj
Wyświetlanie 1-10 z 13
Tytuł:
The identification of Enterococcus spp. at the species level using rpoB and tuf genes sequencing
Identyfikacja gatunkowa bakterii z rodzaju Enterococcus z zastosowaniem sekwencjonowania genów rpoB i tuf
Autorzy:
Dziadowiec, Alicja
Opis:
Bakterie z rodzaju Enterococcus to Gram-dodatnie, względnie beztlenowe ziarniaki, należące do prawidłowej mikroflory ludzi i zwierząt, kolonizujące w szczególności jelito grube człowieka. Należą do patogenów oportunistycznych, które w sprzyjających warunkach wywołują zakażenia kliniczne, m.in. układu moczowego, zapalenia wsierdzia, a nawet bakteriemię. Do identyfikacji gatunkowej bakterii z rodzaju Enterococcus wykorzystuje się reakcje PCR określonych fragmentów genomu bakteryjnego, a następnie ich sekwencjonowanie. W niniejszej pracy w celu porównania metod identyfikacji gatunkowej zastosowano sekwencjonowanie genów rpoB oraz tuf, a następnie na ich podstawie określono pokrewieństwo badanych szczepów. Analiza sekwencji genu rpoB pozwoliła na identyfikację 100% badanych szczepów na poziomie gatunku, a genu tuf – 78%. Filogenetyczna analiza pokrewieństwa wskazała na różnice w procesie ewolucji genów rpoB i tuf u poszczególnych gatunków bakterii Enterococcus spp.
The Enterococcus genus consist of Gram-positive and facultative anaerobic cocci, colonizing humans and animals large intestine. Enterococci belong to opportunistic pathogens that in specific conditions cause clinical infections, including urinary tract infections, endocarditis, and bacteraemia. The PCR-based methods combined with sequencing are used for Enterococcus identification at the species level. In this work, in order to compare the methods of species identification, the sequencing of the rpoB and tuf genes was used, and then the relationship between the tested strains was determined. Analysis of the rpoB and tuf genes sequences allowed the identification at the species level of 100% and 78% strains, respectively. The phylogenetic analysis of kinship indicated the differences in the evolution of the rpoB and tuf genes in particular species of Enterococcus spp.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
Tytuł:
A universal method for the identification of genes encoding amatoxins and phallotoxins in poisonous mushrooms
Autorzy:
Woloszyn, A.
Kotlowski, R.
Tematy:
identification method
gene encoding
amatoxin
phallotoxin
poisonous mushroom
polymerase chain reaction
Pokaż więcej
Wydawca:
Narodowy Instytut Zdrowia Publicznego. Państwowy Zakład Higieny
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/875623.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
Background. As the currently known diagnostic DNA targets amplified in the PCR assays for detection of poisonous mushrooms have their counterparts in edible species, there is a need to design PCR primers specific to the genes encoding amanitins and phallotoxins, which occur only in poisonous mushrooms. Objective. The aim of the study was testing of PCR-based method for detection of all genes encoding hepatotoxic cyclic peptides - amanitins and phallotoxins present in the most dangerous poisonous mushrooms. Material and Methods. Degenerate primers in the PCR were designed on the basis of amanitins (n=13) and phallotoxins (n=5) genes in 18 species of poisonous mushrooms deposited to Genbank of the National Center for Biotechnology Information. Results. The specificity of the PCR assays was confirmed against 9 species of edible mushrooms, death cap - Amanita phalloides and panther cap - Amanita pantherina. Conclusions. Designed two couples of PCR-primers specific to amanitins and phallotoxins genes can be recommended for detection of Amanita phalloides and other mushroom species producing hepatotoxic cyclic peptides - amanitins and phallotoxins.
Wprowadzenie. Ponieważ, obecnie znane diagnostyczne cele molekularne w genomach trujących grzybów kapeluszowych amplifikowane metodą PCR mają swoje odpowiedniki u grzybów jadalnych, istnieje potrzeba zastosowania specyficznych sekwencji starterowych wobec amanityn i fallotoksyn, występujących jedynie u grzybów trujących. Cel. Celem prowadzonych badań było sprawdzenie przydatności sekwencji starterowych do reakcji PCR specyficznych wobec wszystkich aktualnie poznanych genów kodujących hepatotoksyczne cykliczne peptydy - amanityny oraz fallotoksyny trujących grzybów kapeluszowych. Materiał i Metody. Sekwencje oligonokleotydowe starterów do reakcji PCR zaprojektowane zostały w oparciu o zdeponowane w Genbanku geny amanityn (n=13) oraz fallotoksyn (n=5). Wyniki. Specyficzność opracowanych testów PCR potwierdzono wobec 9 gatunków grzybów jadalnych oraz muchomora sromotnikowego - Amanita phalloides, jak i muchomora plamistego - Amanita pantherina. Wnioski. Zastosowane sekwencje starterowe do wykrywania genów kodujących amanityny i fallotoksyny metodą PCR, mogą być wykorzystane do wykrywania muchomora sromotnikowego oraz innych gatunków zdolnych do syntezy amanityn oraz fallotoksyn.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Molecular typing of Staphylococcus aureus based on PCR-RFLP of coa gene and RAPD analysis
Autorzy:
Karakulska, J.
Pobucewicz, A.
Nawrotek, P.
Muszynska, M.
Furowicz, A.J.
Czernomysy-Furowicz, D.
Tematy:
molecular typing
Staphylococcus aureus
PCR-RFLP method
coa gene
random amplified polymorphic DNA analysis
mastitis
nuc gene
gap gene
milk sample
species identification
Pokaż więcej
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/31963.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
The aim of this study was molecular identification of S. aureus strains isolated from mastitic milk samples and establishing the genetic relationship between strains isolated from cows belonging to the same herd. In all 43 isolated strains the gap gene (930 bp) was amplified, which enabled their affiliation to the Staphylococcus genus to be established. PCR-RFLP with AluI endonuclease of the gap gene as well as nuc (450 bp) and coa (1130 bp) gene amplification allowed precise S. aureus species identification. One hundred percent of the genetic relationship between strains was established via RAPD-PCR and coa-typing.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Bacterial species identification
Autorzy:
Kshikhundo, Ronald
Itumhelo, Shayalethu
Tematy:
16S rRNA gene
Bacteria
Biolog
Gram staining
MALDI-TOF MS
RiboPrinter
computational tools
fatty acids
identification
metagenomics
morphology
Pokaż więcej
Wydawca:
Przedsiębiorstwo Wydawnictw Naukowych Darwin / Scientific Publishing House DARWIN
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1153736.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
The traditional methods of bacterial identification are based on observation of either the morphology of single cells or colony characteristics. However, the adoption of newer and automated methods offers advantage in terms of rapid and reliable identification of bacterial species. The review provides a comprehensive appreciation of new and improved technologies such fatty acid profiling, sequence analysis of the 16S rRNA gene, matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF), metabolic finger profiling using BIOLOG, ribotyping, together with the computational tools employed for querying the databases that are associated with these identification tools and high throughput genomic sequencing in bacterial identification. It is evident that with the increase in the adoption of new technologies, bacterial identification is becoming easier.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identyfikacja cDNA genu RSH [RelA-SpoT homolog] zaangazowanego w odpowiedz Pharbitis nil na warunki stresowe
Autorzy:
Dabrowska, G
Prusinska, J
Goc, A
Tematy:
Pharbitis nil
mechanizmy adaptacji
cDNA
sekwencja genu
czynniki stresowe
odpowiedz scisla
identyfikacja
adaptation mechanism
gene sequence
stress factor
identification
Pokaż więcej
Wydawca:
Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie. Wydawnictwo Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/797135.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
Stres środowiskowy jest z jednym z głównych czynników limitujących wzrost i rozwój roślin. Przeszukiwanie biblioteki cDNA Pharbitis nil z liścieni roślin zaindukowanych do kwitnienia sondą SOD3.1 kodującą manganową dysmutazę ponadtlenkową pszenicy, umożliwiło zidentyfikowanie sekwencji długości 798 pz. Sekwencja ta wykazuje najwyższą homologię do roślinnych genów RSH, homologicznych do bakteryjnych RelA i SpoT. Białka kodowane przez te geny uczestniczą w odpowiedzi ścisłej - wysoce konserwowanym mechanizmie odpowiedzi na stres.
Environmental stress is one of the main factors limiting plant growth and development. The cDNA library constructed from cotyledons of Pharbitis nil plants photoinduced for flowering was screened by probe SOD3.1 coding wheat manganese superoxide dismutase. The cDNA sequence of 798 bp was isolated showing the highest identity to the plant RSH genes which are homologs of bacterial RelA and SpoT genes. Their protein products participate in the stringent response - a highly conserved mechanism of stress response.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Cloning of the DNA fragments reflecting the open reading frame I and II of the I-18 C gene of Chironomus tentans. V. Identification of the bacterial colonies, containing the recombinant bluescript plasmids
Autorzy:
Borowicz, B P
Tematy:
pET-3a vector
promoter system
cloning
I-18 C gene
T7 RNA polymerase
plasmid
Chironomus tentans
polymerase chain reaction
DNA fragment
identification
Pokaż więcej
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Czytelnia Czasopism PAN
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/65003.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
The technology applied for the cloning of the open reading frame (ORF) I and II reflecting DNA fragments in regard to the identification of the bacterial colonies, of E. coli XL-1 strain, containing the recombinant bluescript plasmids, is described. The particular steps include: the α-complementation test, growing of the preliminary selected bacterial colonies in culture, isolation of the plasmids from these colonies, the Nde I and Bam HI digestion of the plamids mini-preparations, analysis of the digestion products and the identification of the bacterial colonies, containing the bluescript plasmids with the cloned inserts by the agarose gel electrophoresis (2% gel, 1 x TBE buffer).
Opisano technologię zastosowaną do klonowania fragmentów DNA odzwierciedlających otwartą ramę odczytu I i II genu I-18 C Chironomus tentans, w zakresie: identyfikacji kolonii bakteryjnych szczepu XL-1, zawierających zrekombinowane plazmidy blueskrypt. Poszczególne etapy obejmowały: test α-komplementacji, hodowlę wstępnie wybranych kolonii bakteryjnych, izolację plazmidów bakteryjnych poszczególnych kolonii z tych hodowli, trawienie mini-izolatów plazmidów Nde I i Bam HI, analizę produktów trawienia i identyfikację kolonii bakteryjnych, zawierających plazmidy blueskrypt z wklonowanymi wstawkami przy zastosowaniu elektroforezy w żelu agarozowym (2% żel, 1 x stężony bufor TBE).
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Wyświetlanie 1-10 z 13

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies