Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "genomy" wg kryterium: Temat


Wyświetlanie 1-10 z 10
Tytuł:
Przydatnosc metod analizy genomu w diagnostyce giardiozy i kryptosporydiozy
Autorzy:
Kasprzak, W
Majewska, A.C.
Tematy:
kryptosporydioza
choroby inwazyjne
parazytologia
genomy
diagnostyka
giardioza
metody analizy
Pokaż więcej
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/840681.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
The article comprises a critical review on practical applications of molecular technology in parasitological diagnostics in a broad sense, also as a diagnosis of species and a method of epidemiological analysis. Techniques of genome analysis at different levels, as specific nucleic acid probes, DNA restriction profiles (RFLP), hybridization techniques, pulse-field gel electrophoresis, in vitro nucleic acid amplification, and DNA fingerprint technique used in studies on Giardia and Cryptosporidium were discussed. The essential reservation as far as this technology is concerned refers to its usefulness in parasitological diagnostics; there is no sense in working out methods for recognizing parasites which could otherwise be identified by well trained parasitologists and simple microscopic methods. The improved diagnosis of parasites resulting from the application of molecular technology significantly contributed to the armentarium of parasitologists. Application of recent molecular technology in diagnosis of giardiosis and cryptosporidiosis may basically support clinical diagnosis which provides possibilities of early and selective treatment and makes possible epidemiological studies. These assays will permit not only a rapid diagnosis and exact differentiation but will also enable a better recognition of Giardia and Cryptosporidium genome organization. However, in spite of the wide availability of this new techniques they have not been fully applied - as yet – in diagnosis and in epidemiological studies on these parasites. The authors share the opinion of BUSCH (1991) on the need of proper recognition of high-quality and rigorous work in employing new molecular assays, because their wide availability and high sensitivity could cause "false-positive" results by contamination with amplified DNA sequences. They totally support the conclusion made by THOMPSON and MELONI (1993) that the molecular data must be fairly interpreted by collaborating molecular biologists, parasitologists, and epidemiologists - and clinicians as well - to avoid forming of a confusing picture of genetic diversity of the parasites with no practical application.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Przydatność metod analizy genomu w diagnostyce giardiozy i kryptosporydiozy
APPLICATION OF MOLECULAR BIOLOGY IN DIAGNOSIS OF GIARDIOSIS AND CRYPTOSPORIDIOSIS
Autorzy:
Kasprzak, W.
Majewska, A.C.
Tematy:
kryptosporydioza
choroby inwazyjne
parazytologia
genomy
diagnostyka
giardioza
metody analizy
Pokaż więcej
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Parazytologiczne
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2151375.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
The article comprises a critical review on practical applications of molecular technology in parasitological diagnostics in a broad sense, also as a diagnosis of species and a method of epidemiological analysis. Techniques of genome analysis at different levels, as specific nucleic acid probes, DNA restriction profiles (RFLP), hybridization techniques, pulse-field gel electrophoresis, in vitro nucleic acid amplification, and DNA fingerprint technique used in studies on Giardia and Cryptosporidium were discussed. The essential reservation as far as this technology is concerned refers to its usefulness in parasitological diagnostics; there is no sense in working out methods for recognizing parasites which could otherwise be identified by well trained parasitologists and simple microscopic methods. The improved diagnosis of parasites resulting from the application of molecular technology significantly contributed to the armentarium of parasitologists. Application of recent molecular technology in diagnosis of giardiosis and cryptosporidiosis may basically support clinical diagnosis which provides possibilities of early and selective treatment and makes possible epidemiological studies. These assays will permit not only a rapid diagnosis and exact differentiation but will also enable a better recognition of Giardia and Cryptosporidium genome organization. However, in spite of the wide availability of this new techniques they have not been fully applied - as yet – in diagnosis and in epidemiological studies on these parasites. The authors share the opinion of BUSCH (1991) on the need of proper recognition of high-quality and rigorous work in employing new molecular assays, because their wide availability and high sensitivity could cause "false-positive" results by contamination with amplified DNA sequences. They totally support the conclusion made by THOMPSON and MELONI (1993) that the molecular data must be fairly interpreted by collaborating molecular biologists, parasitologists, and epidemiologists - and clinicians as well - to avoid forming of a confusing picture of genetic diversity of the parasites with no practical application.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zmiennośc genetyczna jako jeden z podstawowych parametrów determinujących poziom sprawności fizycznej człowieka
Genetic variability as one of the principal parameters determining human physical performance
Autorzy:
Cieszczyk, P.
Maciejewska, A.
Sawczuk, M.
Tematy:
czlowiek
sprawnosc fizyczna
sport
czynniki genetyczne
zmiennosc genetyczna
genomy
geny
wysilek fizyczny
Pokaż więcej
Wydawca:
Uniwersytet Szczeciński. Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Szczecińskiego
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/789898.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identyfikacja nowych markerów DNA do badania filogenezy niesporczaków
Identification of new DNA markers for resolving tardigrade phylogeny
Autorzy:
Surmacz, Bartłomiej
Opis:
Tardigrades are a phylum of microscopic invertebrates classified within Ecdysozoa. Despite a number of phylogenetic studies, the relationships within this group are still far from being understood. That is partially the effect of a limited number of DNA markers used in the phylum. The majority of the recent molecular phylogenetic works on Tardigrada are based on a few nuclear ribosomal and/or mitochondrial genes. This thesis presents a workflow of development of new nuclear markers, starting from a bioinformatic analysis of 13 eutardigrade genomes, through primer development, laboratory testing (PCR and sequencing), to the analysis of the sequences. As the result, a set of seven protein-coding genes, which can potentially be used as new DNA markers for inferring tardigrade phylogeny, was obtained. The phylogenetic analysis of new markers for seven species from distantly related linages gave results congruent with the widely-accepted tardigrade phylogeny.
Niesporczaki stanowią typ mikroskopijnych bezkręgowców zaliczanych do wylinkowców (Ecdysozoa). Pomimo stosunkowo licznych badań nad ich filogenezą, pokrewieństwa wewnątrz tej grupy zwierząt nadal są słabo zbadane. Ich poznanie częściowo ograniczone jest przez niewielką liczbę markerów DNA wykorzystywanych w badaniach tej grupy. Większość obecnych badań molekularnych nad filogenezą niesporczaków oparta jest na kilku jądrowych markerach rybosomalnych oraz genów mitochondrialnych. W niniejszej pracy przedstawiony został proces poszukiwania nowych markerów, począwszy od analizy bioinformarycznej 13 genomów, poprzez zaprojektowanie starterów, testy laboratoryjne (PCR i sekwencjonowanie), na analizie uzyskanych sekwencji kończąc. Wynikiem przeprowadzonych badań jest siedem genów, które potencjalnie mogą być wykorzystywane jako markery molekularne służące do badań nad filogenezą niesporczaków. Analizy filogenetyczne siedmiu gatunków niesporczaków reprezentujących daleko spokrewnione linie przy użyciu nowych markerów dały wyniki zgodne z powszechnie przyjętą filogenezą głównych linii niesporczaków.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
Tytuł:
Genomic organization and nucleotide sequence of the repetitive DNA from Vicia sativa L.
Organizacja i struktura pierwszorzędowa sekwencji powtarzających się w genomie Vicia sativa L.
Autorzy:
Lehmann, P.
Kozubek, E.
Tematy:
Vicia sativa
sekwencje powtarzajace sie
struktura pierwszorzedowa
genetyka roslin
genomy
biologia molekularna
DNA
Pokaż więcej
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Instytut Genetyki Roślin PAN
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/61681641.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Classification of contigs for sequences of chromosomal and plasmid origin in Staphylococcus aureus.
Klasyfikacja kontigów na sekwencje pochodzenia chromosomowego i plazmidowego u Staphylococcus aureus
Autorzy:
Pawliszko, Michał
Opis:
Due to the low cost of next-generation sequencing methods, an increase in sequencing data for many organisms in the form of incomplete genomes consisting of several to several-hundred contigs has been observed in recent years. This also applies to Staphylococcus, one of the most common human pathogens. Due to the structure of the genetic material of bacteria, which consists of chromosomal and plasmid DNA, in these cases it becomes problematic to accurately determine the origin of a given contig. Most of the existing contig classification tools are not optimized for specific species of bacteria, including Staphylococci, which reduces their classification accuracy. This thesis presents the developed model of machine learning, which is based on the random forest algorithm, using the frequencies of the nucleotide 6-mers in sequences as classification features, allowing for accurate prediction of chromosomal and plasmid sequences in Staphylococcus. The obtained model got greater classification accuracy compared to other existing tools and allowed for the prediction of potential chromosomal and plasmid contigs in incomplete genomes of Staphylococcus aureus.The research has been supported by the National Science Centre in Poland as a part of the project No. 2016/21/D/NZ1/00273.
Ze względu na relatywnie niski koszt metod sekwencjonowania nowej generacji, w ostatnich latach można zaobserwować przyrost danych z sekwencjonowania dla wielu organizmów w postaci niekompletnych genomów składających się z kilku do kilkuset kontigów. Dotyczy to również bakterii Staphylococcus aureus, będącej jednym z najpowszechniejszych oportunistycznych patogenów ludzkich. Z uwagi na budowę materiału genetycznego bakterii, który składa się z chromosomowego oraz plazmidowego DNA, problematycznym staję się w tych przypadkach dokładne określenie pochodzenia danego kontigu. Większość istniejących narzędzi do klasyfikacji kontigów nie jest zoptymalizowana pod określone rodzaje bakterii, w tym gronkowce, co zmniejsza ich dokładność klasyfikacyjną. Niniejsza praca prezentuje stworzony model uczenia maszynowego, który opiera się na algorytmie lasów losowych, wykorzystującym częstości występowania 6-merów nukleotydowych w sekwencjach jako cech klasyfikacyjnych, pozwalającym na dokładną predykcje sekwencji chromosomowych oraz plazmidowych u Staphulococcus. Otrzymany model uzyskał większą dokładność klasyfikacyjną porównaniu do innych istniejących narzędzi oraz pozwolił na predykcje potencjalnych kontigów chromosomowych oraz plazmidowych w niekompletnych genomach gronkowca złocistego.Badania przeprowadzone na potrzeby niniejszej pracy zostały wsparte ze środków Narodowego Centrum Nauki przyznanych w ramach projektu nr 2016/21/D/NZ1/00273
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
    Wyświetlanie 1-10 z 10

    Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies