Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "molecular hydrogen" wg kryterium: Temat


Tytuł:
Protective effects of molecular hydrogen on hepatotoxicity induced by sub-chronic exposure to chlorpyrifos in rats
Autorzy:
Xun, ZM.
Xie, F.
Zhao, PX.
Liu, MY.
Li, ZY.
Song, JM.
Kong, XM.
Ma, XM.
Li, XY.
Tematy:
oxidative stress
hepatotoxicity
chlorpyrifos
molecular hydrogen
mitochondrial pathway
Pokaż więcej
Wydawca:
Instytut Medycyny Wsi
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/2085965.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
Introduction. Chlorpyrifos (CPF) is a organophosphate insecticide widely used in agriculture with attendant adverse health outcomes. Chronic exposure to CPF induces oxidative stress and elicits harmful effects, including hepatic dysfunction. Molecular hydrogen has been identified as a novel antioxidant which could selectively scavenge hydroxyl radicals. Objective. The aim of this study was to determine whether the intake of hydrogen-rich water (HRW) could protect rats from hepatotoxicity caused by sub-chronic exposure to CPF. Materials and method. Rats were treated with hydrogen-rich water by oral intake for 8 weeks. Biochemical indicators of liver function, SOD and CAT activity, GSH and MDA levels were determined by the spectrophotometric method. Liver cell damage induced by CPF was evaluated by histopathological and electron microscopy analysis. PCR array analysis was performed to investigated the effects of molecular hydrogen on the regulation of oxidative stress related genes. Results. Both the hepatic function tests and histopathological analysis showed that the liver damage induced by CPF could be ameliorated by HRW intake. HRW intake also attenuated CPF induced oxidative stress, as evidenced by restored SOD activities and MDA levels. The results of PCR Array identified 12 oxidative stress-related genes differentially expressed after CPF exposure, 8 of chich, including the mitochondrial Sod2 gene, were significantly attenuated by HRW intake. The electron microscopy results indicated that the mitochondrial damage caused by CPF was alleviated after HRW treatment. Conclusions. The results obtained suggest that HRW intake can protect rats from CPF induced hepatotoxicity, and the oxidative stress signaling and the mitochondrial pathway may be involved in the protection of molecular hydrogen.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Obtaining of Gold from Slovak Concentrate by Using an Innovative Method
Pozyskiwanie złota ze słowackiego koncentratu przy użyciu innowacyjnej metody
Autorzy:
Ficeriová, Jana
Dutková, Erika
Tematy:
gold
algae
molecular hydrogen
mechanical activation
złoto
algi
wodór molekularny
aktywacja mechaniczna
Pokaż więcej
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Przeróbki Kopalin
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/59114954.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
The complicated processing of concentrates with low gold content and the long-time use of non-ecological methods was the motion for finding a more efficient process for this noble metal obtaining. From this point of view, this research was focused on obtaining of nano gold from the concentrate White Hill (Detva, Slovakia) using mechanical activation and mechano-biological activation in a molecular hydrogen solution. Gold in this complex concentrate occurs physically enclosed in the intercrystalline space of minerals and is also isomorphic and fills defects in their structure. The exclusion of gold from such complex mineral matrixes of the concentrate can be achieved using a mechano-biological process. This innovative method for obtaining of nano gold with the application of a molecular hydrogen solution is an advantageous alternative to the non-environmental reagents used. Compared to the most used worldwide toxic cyanide reagent, a solution with molecular hydrogen represents a low-cost and above all completely harmless reagent with very good kinetics. Mechanical processes use high-energy milling, which has an effect on the more intensive formation of surface and bulk defects in solid substances. The main advantage of mechanical processes is a smaller number of technological operations, a shorter time required to obtain the desired product at favorable environmental temperatures, and also the formation of nanostructures. The use of a biological process with the application of limnetic algae showed that algae with siliceous structures make it possible to obtain gold from the White Hill concentrate with nanoscale size. Limnetic algae (diatoms, golden algae) are part of aquatic ecosystems and create the largest matter of biomass from all plants on the Earth. The mechano-biological process is a method that enabled to obtain of gold nanoparticles with an average size of 100 nm from the Slovak gold-bearing concentrate from the White Hill deposit (BV-1). Mechanical activation of this concentrate and siliceous shells of the specified limnetic algae (Dinobryon, Surirella) in a molecular hydrogen solution caused changes in the physical-chemical properties of gold minerals as well as in the constituents of algae minerals. These structural changes had a decisive influence on the exclusion of gold nanoparticles into the molecular hydrogen solution under the defined reaction conditions. The gold nanoparticles were subsequently fixed in the cellular matrix of mechanically activated algae shells. The explanation of this phenomenon was the action of biomolecules, which the algae cells secreted in the course of reactions with metal ions present in the molecular hydrogen solution. Gold nanoparticles from the investigated concentrate were obtained by a new mechano-biological procedure already for four hours. In the case of mechanical activation of the concentrate, but without activation of the used algae, gold nanoparticles were excluded after sixteen hours. It follows from this knowledge that the application of an absolutely ecologically harmless aqueous solution enriched by molecular hydrogen and the use of limnetic algae confirmed the suitability of the innovative method for obtaining of nano gold from the concentrate. From the achieved research results significantly more effective kinetics is evident in the case of activated algae. Nanoparticles of gold obtained by the mentioned procedure can have important practical utilization, such as accelerating of the decomposition of dangerous substances or neutralizing pollutants in contaminated water, soil, and air. Simultaneously, obtaining of gold nanoparticles would also be beneficial for removing algae from the aquatic environment, where they are very dangerous for all living organisms.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Badanie właściwości niesymetrycznie podstawionych 4,5-dialkoksy-2-nitroanilin metodami spektroskopowymi i teoretycznymi.
A study of the properties of unsymmetrically substituted 4,5-dialkoxy-2-nitroanilines by spectroscopic and theoretical methods.
Autorzy:
Synowiec, Karina
Opis:
Celem pracy była synteza i zbadanie własności dwóch niesymetrycznie podstawionych izomerów konstytucyjnych 4,5 – dialkoksy – 2 – nitroanilin. Wybrano związki podstawione grupą etoksylową oraz grupą izobutoksylową. Następnie wykonano szereg pomiarów spektroskopowych w celu określenia własności fizykochemicznych badanych układów. Związki przebadano doświadczalnie, stosując techniki takie jak: rentgenografia strukturalna, dyfraktometria proszkowa, spektroskopia magnetycznego rezonansu jądrowego, spektroskopia w zakresie środkowej podczerwieni oraz spektroskopia UV-Vis. Do wyjaśnienia i opisania otrzymanych wyników doświadczalnych wykorzystano teoretyczne metody kwantowo-mechaniczne „statyczne” (metoda pola samouzgodnionego) i „dynamiczne” (kwantowa dynamika molekularna). Zarejestrowane dla obydwóch związków dyfraktogramy oraz ich widma 1H NMR pozwoliły stwierdzić, że struktura otrzymanych związków jest zgodna z danymi literaturowymi. Wykorzystując metodę teorii funkcjonałów gęstości zależnych od czasu obliczono energie kolejnych stanów singletowych i przypisano odpowiednie przejścia do pasm obserwowanych w widmie UV. Dynamika molekularna pozwoliła obliczyć zmienne w czasie geometrie cząsteczek obydwu związków w fazie krystalicznej i porównać je z danymi literaturowymi. Obliczone z trajektorii momentów dipolowych teoretyczne widma IR związków porównano z widmami doświadczalnymi, co pozwoliło na interpretację odpowiednich pasm.
The aim of this study was to synthesise and investigate the properties of two asymmetrically substituted constitutional isomers of 4,5-dialkoxy-2-nitroanilines. The compounds substituted with an ethoxy group and an isobutoxy group were chosen. A series of spectroscopic measurements were then carried out to determine the physicochemical properties of the systems studied. The compounds were tested experimentally using techniques such as structural X-ray, powder diffractometry, nuclear magnetic resonance spectroscopy, mid-infrared spectroscopy and UV-Vis spectroscopy. Theoretical quantum mechanical 'static' (self-consistent field method) and 'dynamic' (quantum molecular dynamics) methods were used to explain and describe the experimental results received. The diffractograms recorded for both compounds and their 1H NMR spectra allowed to conclude that the structure of the obtained compounds is in agreement with literature data. Using the method of time-dependent density functional theory, the energies of successive singlet states were calculated and the corresponding transitions were assigned to the bands observed in the UV spectrum. Molecular dynamics allowed the time-varying geometries of the molecules of both compounds in the crystalline phase to be calculated and compared with literature data. The theoretical IR spectra of the compounds, calculated from the trajectories of the dipole moments, were compared with the experimental spectra, allowing the interpretation of the corresponding bands.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
Tytuł:
Spectroscopic and theoretical analysis of the effect of fluorine substitution on the strength of intermolecular hydrogen bonds.
Teoretyczna i spektroskopwa analiza wpływu podstawienia fluorem na siłe międzycząsteczkowych wiązań wodorowych
Autorzy:
Pietruś, Wojciech
Opis:
Fluorine is the most electronegative element occurring in the nature.Introduction of fluorine atom to the molecule determines many of itsphysicochemical properties, i.e.: acidic character of neighbouringfunctional groups, basicity amines, bioavailability, lipophilicity,metabolic stability, etc. Nowadays, fluorination of drugs has becomea standard strategy to increase bioavailability and to optimisebiological activity. Since the 1950s, over 200 fluorine-containingdrugs have been released to the market which now makes up approx.20% of all pharmaceuticals.Hydrogen bonds are one of the best known intermolecularinteractions. They affect many properties of compounds such asboiling point and conductivity, but they also determine structure ofproteins and DNA. Infrared spectroscopy is the most commonly usedmethod to study the hydrogen bonding, whose presence significantlymodifies the bands involved in the formation of H-bonds. However,despite such great importance in nature, there is no systematic studyon the influence of fluoro substituent on the strength ofintermolecular hydrogen bonds. Infrared spectroscopy is the mostcommonly used method to study the hydrogen bonding, because thegroups involved in hydrogen bridge formation have significantlymodified bands.The aim of the thesis was to investigate the effect of fluorinesubstitution of the aromatic ring on the strength of the intermolecularH-bonds, to utilize the obtained results in the rational design of newdrugs.A broad range of methods were used (i.e.: electrostatic potentialsurface (EPS), FTIR infrared spectroscopy, X-ray crystallography(XRD) and ab initio molecular dynamics (AIMD)), to investigate theeffect of fluorine substitutions on the strength of hydrogen bondingin aniline. The choice of aniline as a model system stems from thefact that fluorinated aromatic ring is present in more than 50% offluorinated drugs.Results showed that the insertion of a fluorine atom into an anilinemolecule reduces the strength of intermolecular hydrogen bonds,particularly for 3-fluoroaniline, however, fluorine itself is not involved in H-bonds formation. Additional analysis of moleculardynamics and crystal structures showed that fluorine in the paraposition increases the availability of free electron pair of thenitrogen, which in consequence increases the number of H-bonds.Theoretical spectra obtained from the molecular dynamics showedhigh compatibility with the experimental data.
Fluor jest najbardziej elektroujemnym pierwiastkiem występującymw naturze. Wprowadzenie go do cząsteczki determinuje wiele jejwłaściwości fizykochemicznych, takich jak: kwasowośćsąsiadujących grup funkcyjnych, zasadowość amin, biodostępność,lipofilowość, stabilność metaboliczną, itp. Obecnie, fluorowanieprojektowanych leków stało się standardową strategią mającą nacelu zwiększenie biodostępności oraz optymalizacji ich aktywnościbiologicznej. Od 1950 roku na rynek wprowadzono ponad 200fluorowanych leków, które obecnie stanowią około 20% wszystkichmedykamentów.Wiązania wodorowe są jednymi z najlepiej poznanych oddziaływańmiędzycząsteczkowych. Wpływają one na wiele różnychwłaściwości substancji chemicznych (np. temperaturę wrzenia czyprzewodnictwo roztworów), a także determinują budowę białek czyDNA. Jednak pomimo tak ogromnego znaczenia w przyrodzie, brakjest w literaturze systematycznych badań wpływu podstawnikafluorowego na siłę międzycząsteczkowych wiązań wodorowych.Najczęściej stosowaną metodą do badań wiązań wodorowych jestspektroskopia w podczerwieni, ponieważ ugrupowaniazaangażowane w tworzenie mostków wodorowych mają znaczącozmodyfikowane pasma.Celem pracy magisterskiej było zbadanie wpływu pozycjisubstytucji fluoru w pierścieniu aromatycznym na siłęmiędzycząsteczkowych wiązań wodorowych. by w przyszłościotrzymane rezultaty wykorzystać w racjonalnym projektowaniunowych leków.W niniejszej pracy wykorzystano różne metody badawcze (m.in.powierzchnie potencjału elektrostatycznego (ang. EPS),spektroskopię w podczerwieni FTIR, krystalografię rentgenowską(XRD) oraz dynamikę molekularną ab initio (ang. AIMD)), w celuwyjaśnienia wpływu substytucji fluoru na siłę wiązań wodorowychna przykładzie aniliny. Wybór modelowego układu wynikał z faktu,iż w ponad 50% fluorowanych leków podstawienie fluoremwystępowało bezpośrednio w pierścieniu aromatycznym.Badania wykazały, że wstawienie atomu fluoru do cząsteczki anilinyzmniejsza siłę międzycząsteczkowych wiązań wodorowych,szczególnie dla 3-fluoroaniliny, jednak sam fluor nie angażuje się wtworzenie mostków wodorowych. Analiza dynamiki molekularnejoraz struktur krystalicznych wykazała, że fluor w pozycji parazwiększa dostępność wolnej pary elektronowej na atomie azotu, coindukowało większą ilość powstających wiązań wodorowych.Otrzymane na podstawie dynamiki molekularnej widma teoretycznewykazały dużą zgodność z eksperymentem.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
Tytuł:
Sole ko-krystaliczne z udziałem luminescencyjnych kompleksów Pt(II) i dedykowanych organicznych tektonów supramolekularnych.
Co-crystalline salts with the participation of luminescent Pt (II) complexes and dedicated organic supramolecular tectons.
Autorzy:
Głosz, Dorota
Opis:
Projektowanie oraz synteza materiałów molekularnych od lat stanowią istotny kierunek badań podstawowych w obszarze nauk przyrodniczych i cieszą się zainteresowaniem naukowców z całego świata. Na szczególną uwagę zasługuje modularna konstrukcja faz ko krystalicznych z wykorzystaniem odpowiednio dobranych bloków budulcowych, która pozwala na dostosowywanie właściwości funkcjonalnych materiału do oczekiwań, poprzez topologiczną adaptację tektonów w konkretnych obszarach architektur supramolekularnych bez istotnej zmiany uporządkowania lokalnego.Niniejsza praca prezentuje analizę strukturalną i charakterystykę spektroskopową dwóch nowych, unikalnych soli ko krystalicznych (Pt2rez3 i Pt1rez3) zawierających anionowe kompleksy platyny(II) [Pt(L^L)(CN)2]n– (L^L = ptpy, bhp; n = 1, 2), tetra alkilowe kationy organiczne (Et4N+ i n-Bu4N+) oraz cząsteczki trójpierścieniowej polirezorcyny (C18H14O4) w roli koformera. W strukturze krystalicznej uzyskanych układów widoczne są motywy tworzone przez wiązania wodorowe angażujące atomy azotu ligandów cyjankowych anionów kompleksowych Pt(II) oraz grupy hydroksylowe pochodzące od organicznych cząsteczek polirezorcynowych. Dla otrzymanych produktów obserwowana jest luminescencja o relatywnie wysokiej intensywności związana m. in. z obecnością karboanionów, gdzie zakres długości fali oraz intensywność emisji zależy od poszczególnych syntonów angażujących wiązania wodorowe. Podsumowując, w wyniku przeprowadzonych badań, otrzymano nowe układy supramolekularne łączące w sobie cechy wykorzystanych prekursorów, w tym właściwości fotoluminescencyjne.
Design and synthesis of molecular materials represent an important direction of basic research in the field of life sciences and continuously draw interest of scientists from around the world. A modular construction of the co-crystalline phases with the use of appropriately selected building blocks is of particular interest, as it allows to adjust the functional properties of the material to specific expectations, through topological adaptation of tectons in the specified areas of supramolecular architectures without a significant change in local arrangement.This work presents the structural and spectroscopic characterisation of two new, unique co-crystal salts (Pt2rez3 and Pt1rez3) containing anionic platinum(II) complexes [Pt(L^L)(CN)2]n– (L^L = ptpy, bhp; n = 1, 2), tetraalkyl organic cations (Et4N+ and n-Bu4N+) and linear tricyclic diresorcinol (C18H14O4) molecule as a coformer. The crystal structures of the obtained systems reveal hydrogen bonded motifs engaging nitrogen atoms of cyanide ligands of Pt(II) complex anions and hydroxyl groups belonging to organic diresorcinol molecules. Due to the presence of carbanions, relatively high-intensity emission is still observed in these products with the intensity and wavelength range dependent on the detailed hydrogen bond schemes. In conclusion, as a result of the conducted research, new supramolecular systems were obtained, combining the characteristics of the used precursors, including photoluminescent properties.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
Tytuł:
Theoretical studies of hydrogen bonds infrared spectra in solid formic acid using molecular dynamics
Badania teoretyczne metodami dynamiki molekularnej widm podczerwonych wiązań wodorowych w kryształach kwasu mrówkowego
Autorzy:
Wróbel, Piotr
Opis:
Celem pracy było otrzymanie teoretycznych widm w zakresie podczerwieni kwasu mrówkowego w fazie stałej w temperaturze 77 K dla formy niepodstawionej izotopowo i formy całkowicie zdeuterowanej w grupie hydroksylowej na drodze obliczeń metodami dynamiki molekularnej. Badany układ zawierał dwie komórki elementarne. Używając pakietu CP2K, wykorzystując metodę DFT i używając funkcjonału korelacyjno-wymiennego BLYP, w trakcie badań zoptymalizowano wstępnie pochodzącą z danych literaturowych geometrię badanego układu. Następnie wykonano dokładną optymalizację geometrii pakietem CPMD wykorzystując tą samą metodę. Przeprowadzono analizę wibracyjną dla otrzymanych wyników i do dalszych obliczeń wybrano układ, dla którego otrzymano nieujemne wartości częstości. Wyznaczono trajektorię układu z użyciem dynamiki molekularnej Car-Parrinello. Dla otrzymanych w wyniku transformacji Fouriera funkcji autokorelacji momentu dipolowego teoretycznych widm podczerwonych przypisano występującym w nim pasmom związane z nimi drgania. Udało się ustalić, że w formie zdeuterowanej w grupie hydroksylowej zmiana położenia zachodzi wyłącznie dla pasm związanych z drganiami rozciągającymi O-H(D) i zginającymi C-O-H(D). Widma doświadczalne w zakresie drgań –OH(D) miały większą ilość pasm niż widma teoretyczne, co jest wynikiem stosowanej w trakcie badań metody.
The subject of the study was to receive theoretical infrared spectra of solid formic acid in temperature of liquid nitrogen (77 K) for form containing only protium and form fully substituted by deuterium in hydroxic groups using molecular dynamics methods. The system which has been taken for calculations contained two unit cells. First, its geometry from literature data has been optimized in CP2K package using DFT method with BLYP exchange-correlation functional. Then more accurate optimization in CPMD package with use of the same method has been performed. Vibrational analysis has been made for obtained results and system without negative values of frequency has been chosen for further calculations. By using Car-Parrinello molecular dynamics 600000 trajectory steps of the system have been designated. Finally, theoretical infrared spectra have been obtained by Fourier transformation of dipole moment autocorrelation function. Vibrations corresponding to every band in spectrum have been recognized. It was found that in deuterated in hydroxic groups form change in wavenumber appears only for bands connected with O-H(D) stretching and C-O-H(D) bending vibrations. Experimental spectra in -OH(D) vibrations region have more bands than theoretical spectra which is due to used calculation method.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
Tytuł:
Tailoring the physical properties of non-isocyanate polyurethanes by introducing secondary amino groups along their main chain
Autorzy:
Lalik, Sebastian
Pielichowski, Krzysztof
Raftopoulos, Konstantinos N.
Bukowczan, Artur
Łukaszewska, Izabela
Marzec, Monika
Opis:
A series of linear non-isocyanate polyhydroxyurethanes (NIPUs) were synthesized by aminolysis of a PPO bis-cyclic carbonate with two diamines, one of which (triethylenetetramine, TETA) contains non-reacting secondary amino groups. Thus, varying the composition of the diamine component modulates the density of proton donors. Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) showed that with increasing TETA content in the amine components (20–100 wt%) carbonyl groups tend to form progressively more double hydrogen bonds (HBs). Interestingly, the system without this amine deviates from the trend. In the whole composition range, a higher amount of double HBs correlates monotonously with reduced molecular mobility as observed by differential scanning calorimetry (DSC), dielectric relaxation spectroscopy (DRS), and dynamic mechanical analysis (DMA). It also correlates with the mechanical properties of studied NIPUs which range at room temperature from a viscous liquid to a dimensionally stable, flexible, and durable elastomer, depending on the density of double hydrogen-bonded carbonyls. Hence, the herein proposed approach allows for tailoring thermomechanical properties of NIPUs by modulating density of double hydrogen-bonded carbonyls.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Artykuł
Tytuł:
Analysis of polyurethane co-polymers’ physicochemical properties using interaction energy decomposition methods and the ab initio molecular dynamics
Analiza właściwości fizykochemicznych kopolimerów poliuretanowych za pomocą metod dekompozycji energii oddziaływania i dynamiki molekularnej ab initio.
Autorzy:
Didovets, Yuliia
Opis:
Polimery z pamięcią kształtu to podgrupa „inteligentnych” polimerów. Cechą wyróżniającą te polimery jest zdolność do odzyskiwania trwałej formy po odkształceniu. Kopolimery poliuretanowe są idealnymi kandydatami do zapamiętywania kształtu ze względu na swoją dwusegmentową strukturę, złożoną z „twardych” i „miękkich” segmentów. Dodatkowo, właściwości kopolimerów poliuretanowych zależą bezpośrednio od ich składu chemicznego, a co za tym idzie od oddziaływań między-łańcuchowych. Wiązania wodorowe, utworzone między grupami uretanowymi „twardych” segmentów(HS), są szczególnie ważne ze względu na ich zdolność do nadawania polimerowi nowych właściwości zapamiętywania kształtu.Niniejsza praca stanowi wprowadzenie do badań sieci wiązań wodorowych we wcześniej opisanym kopolimerze polisiloksanowo-poliuretanowym z pamięcią kształtu. Stworzone modele molekularne uwzględniały różne, wzajemne orientacje łańcuchów kopolimerowych. Pozwoliło to na zbadanie wpływu składu chemicznego „twardych” segmentów na charakter oddziaływania między badanymi układami. Dynamika molekularna ab initio i analiza energii oddziaływania zostały zastosowane do postulowanych modeli molekularnych w celu opisu charakteru między-łańcuchowych wiązań wodorowych w ujęciu statycznym oraz dynamicznym.W pierwszej części pracy zbadano naturę między-łańcuchowych wiązań wodorowych pomiędzy grupami uretanowymi „twardych” segmentów. Uzyskane wyniki potwierdzają zdolność HS do tworzenia wiązań wodorowych i podkreślają ograniczenia wynikające z efektów sterycznych. Ponadto, został także zbadany teoretycznie zaprojektowany „twardy” segment z wiązaniem ureanowym. W tej części pracy opisano wiązania wodorowe między grupami ureanowymi i porównano je z odpowiadającymi im wiązaniami wodorowymi między grupami uretanowymi. Wnioski dotyczące zależności między składem chemicznym grupy mocznikowej a siłą obserwowanych wiązań wodorowych zawarto na końcu drugiego rozdziału pracy. „Miękki” segment został częściowo dodany do modeli molekularnych w ostatniej części badań. W tym przypadku omówiono wpływ struktury „miękkiego” segmentu na sieć między-łańcuchowych wiązań wodorowych. Jednym z głównych wyników pracy jest poszerzenie dotychczasowej wiedzy na temat roli wiązań wodorowych w polimerach z pamięcią kształtu a w szczególności zaproponowanie modeli molekularnych, które pozwalają porównywać kopolimery oparte na różnych „twardych” segmentach.
Shape memory polymers are a subgroup of shape changing smart polymers. The distinguishable feature of these polymers is the ability to recover their permanent shape after deformation. Polyurethane copolymers are perfect candidates for shape memory due to their two-segmented structure, composed of Hard and Soft Segments. Additionally, the qualities of polyurethane copolymers directly depend on their chemical composition, and therefore on interchain interactions. Hydrogen bonds, formed between urethane groups of Hard Segments, are particularly important due to their ability to endow the polymer with novel shape memory properties. The present thesis introduces the investigation of hydrogen bonds’ network in previously reported shape-memory polysiloxane-polyurethane copolymer. Created computational models considered different mutual arrangements of copolymer chains to study steric effects arising from the chemical composition of Hard Segments. Ab initio molecular dynamics and energy decomposition analysis were applied for computational models in order to discuss the interchain hydrogen bonds from a dynamic and static point of view. The nature of interchain hydrogen bonds between urethane groups of Hard Segments is studied in the first part of the research. Obtained results prove the potential of HSs to form hydrogen bonds and highlight the limitations that arise due to steric effects. Further, a theoretically suggested urea-bonded Hard Segment is investigated. In this part of the work, hydrogen bonds between urea groups are described and compared to corresponding hydrogen bonds between urethane groups. Conclusions about the relationship between the chemical composition of the urea group and the strength of observed hydrogen bonds are derived at the end of the second section of the thesis. The Soft Segment is partly added to the molecular models during the last part of the research. At this point, the influence of the Soft Segment’s structure on the interchain hydrogen bonds network is discussed. The thesis results in widening the current knowledge about the role of hydrogen bonds in shape memory polymers.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne
Tytuł:
Conformational Stability, TGA, and Molecular Docking Investigations of p-Coumaric Acid with Special Relevance to Anti-Cancer and Antibacterial Activity
Autorzy:
Sathish, M.
Meenakshi, G.
Xavier, S.
Sebastian, S.
Tematy:
conformational analysis
molecular geometry
molecular docking
p-coumaric acid
hydrogen bonding
TGA
Pokaż więcej
Wydawca:
Polska Akademia Nauk. Instytut Fizyki PAN
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1032309.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
In this work an attempt is made to analysis of the possible different conformers of p-coumaric acid (PCA) by using density functional method. The total energy of four possible conformers were calculated by using B3LYP/6-311G(d,p) method. Computational result identifies that the most stable conformer of PCA is C2. The formation of inter- and intra-molecular hydrogen bonding between -OH and -COOH group gave the evidence for dimer formation for PCA molecule. The highest occupied-lowest unoccupied molecular orbital analysis shows that the negative electrostatic region situated over the -COOH group and positive electrostatic potential region are localized on ring system and all hydrogen. The PCA has been screened to anti-microbial activity and found to exhibit anti-bacterial effects. Molecular docking results suggest that PCA may exhibit inhibitory activity against lung cancer protein and may act as potential against lung cancer.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies