Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

Wyszukujesz frazę "proteins" wg kryterium: Temat


Tytuł:
Classifying lipoproteins based on their polar profiles
Autorzy:
Polanco, Carlos
Castañón-González, Jorge
Buhse, Thomas
Uversky, Vladimir
Amkie, Rafael
Tematy:
potential of association
lipoproteins
polar balance
polarity index method
unfolded proteins
folded proteins
partially folded proteins
intrinsically disordered proteins
atherosclerosis
Pokaż więcej
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1038801.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
The lipoproteins are an important group of cargo proteins known for their unique capability to transport lipids. By applying the Polarity index algorithm, which has a metric that only considers the polar profile of the linear sequences of the lipoprotein group, we obtained an analytical and structural differentiation of all the lipoproteins found in UniProt Database. Also, the functional groups of lipoproteins, and particularly of the set of lipoproteins relevant to atherosclerosis, were analyzed with the same method to reveal their structural preference, and the results of Polarity index analysis were verified by an alternate test, the Cumulative Distribution Function algorithm, applied to the same groups of lipoproteins.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Changes of physico-chemical properties of rapeseed proteins during the technological process of protein concentrate production, part I
Zmiany właściwości fizykochemicznych białek rzepaku w procesie technologicznym otrzymywania koncentratu, cz. I
Autorzy:
Kostyra, E.
Kozłowska, H.
Kostyra, H.
Tematy:
repeseed proteins
protein concentrate
proteins complexes
enzymatic hydrolysis
Pokaż więcej
Wydawca:
Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności Polskiej Akademii Nauk w Olsztynie
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1398375.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
Investigations were made of the physical and chemical properties of rapeseed proteins and their changes during the technological process of protein concentrate production. The process of amino acid desamination and decarboxylation takes place during concentrate production. Albumin and globulin fractions form aggregates of the dimer. and trimer type, and aggregates with nucleic acids and polyphenols. The albumin and globulin fractions of the protein concentrate are characterized by different solubility and susceptibility to enzymatic proteolysis than their respective fractions in rapeseed meal.
W pracy badano fizyczne i chemiczne właściwości białek nasion rzepaku podczas technologicznego procesu otrzymywania koncentratu białkowego. Mączkę i koncentrat nasion rzepaku poddano następującym analizom: ekstrakcji metodą Osborna, określeniu składu aminokwasowego, sączeniu molekularnemu na żelu Sephadex G-100 i G-200, określeniu masy cząsteczkowej, elektroforezie na żelu poliakrylamidowym, określeniu rozpuszczalności białek frakcji albumin i globulin w zależności od pH hydrolizie pepsyną i trypsyną. W koncentracie białkowym, w porównaniu z mączką rzepakową, stwierdzono obniżenie się zawartości białek w frakcji albumin i globulin oraz ich wzrost w frakcjach rozpuszczalnych w etanolu i 0,2 M NaOH. We wszystkich frakcjach, za wyjątkiem albumin, stwierdzono mniejszy odzysk aminokwasów w koncentracie niż w śrucie rzepakowej. Największy ubytek aminokwasów zaobserwowano w frakcji globulin koncentratu. Znaczny przyrost zawartości amoniaku i zmniejszenie się zawartości aminokwasów kwaśnych w koncentracie dowodzi o zachodzącej w czasie procesu technologicznego dezaminacji i dekarboksylacji. W wyniku rozdziału frakcji albumin nasion rzepaku i koncentratu na żelu Sephadex G-100 uzyskano frakcje o podobnych objętościach elucji i zakresie mas cząsteczkowych od 10-200 tys. Natomiast w przypadku globulin koncentratu pojawiły się frakcje o odmiennych wartościach objętości elucji. Masy cząsteczkowe tych frakcji zawarte były w granicach od 10-320 tys. W wyniku rozdziałów elektroforetycznych albumin nasion rzepaku rozdzieliły się na cztery frakcje, podczas gdy albuminy koncentratu tylko na trzy. Elektroforetyczne rozdziały globulin nasion rzepaku i koncentratu w obu przypadkach wykazały obecność trzech frakcji. Wyniki te były zgodne z rozdziałami na żelu Sephadex G-200. Albuminy i globuliny nasion rzepaku były lepiej rozpuszczalne niż koncentratu. Albuminy nasion rzepaku najlepiej rozpuszczały się w pH 6,0, a najsłabiej w pH 4,0. Natomiast albuminy koncentratu największą rozpuszczalność wykazywały w pH 3,0, a najmniejszą w pH 2,0 i 4,0. Globuliny nasion rzepaku najlepiej rozpuszczały się w pH 5,0, a najsłabiej w pH 6,0. Natomiast globuliny koncentratu najsłabiej rozpuszczały się w pH 4,0, a najlepiej w pH 5,0. Hydroliza frakcji białkowych nasion rzepaku i koncentratu . za pomocą pepsyny i trypsyny dowiodła istotnych różnic w konformacji badanych frakcji. Fakt ten przejawiał się w uwalnianiu różnych ilości peptydów przez zastosowane enzymy.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Ca2+differently affects hydrophobic properties of guanylyl cyclase-activating proteins (GCAPs) and recoverin.
Autorzy:
Gorczyca, Wojciech
Kobiałka, Marcin
Kuropatwa, Marianna
Kurowska, Ewa
Tematy:
fluorescence
calcium-binding proteins
recoverin
guanylyl cyclase-activating proteins
Pokaż więcej
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1043612.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
Guanylyl cyclase-activating proteins (GCAPs) and recoverin are retina-specific Ca2+-binding proteins involved in phototransduction. We provide here evidence that in spite of structural similarities GCAPs and recoverin differently change their overall hydrophobic properties in response to Ca2+. Using native bovine GCAP1, GCAP2 and recoverin we show that: i) the Ca2+-dependent binding of recoverin to Phenyl-Sepharose is distinct from such interactions of GCAPs; ii) fluorescence intensity of 1-anilinonaphthalene-8-sulfonate (ANS) is markedly higher at high [Ca2+]gfree (10 μM) than at low [Ca2+]free (10 nM) in the presence of recoverin, while an opposing effect is observed in the presence of GCAPs; iii) fluorescence resonance energy transfer from tryptophane residues to ANS is more efficient at high [Ca2+]free in recoverin and at low [Ca2+]free in GCAP2. Such different changes of hydrophobicity evoked by Ca2+ appear to be the precondition for possible mechanisms by which GCAPs and recoverin control the activities of their target enzymes.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
The significance of NGAL and KIM-1 proteins for diagnosis of acute kidney injury (AKI) in clinical practice
Autorzy:
Kubrak, Tomasz
Podgórski, Rafał
Aebisher, David
Gala-Błądzińska, Agnieszka
Tematy:
NGAL proteins
KIM-1 proteins
acute kidney injury (AKI)
Pokaż więcej
Wydawca:
Uniwersytet Rzeszowski. Wydawnictwo Uniwersytetu Rzeszowskiego
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/454694.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
Introduction. Despite advances in medical care AKI (acute kidney injury) is associated with high morbidity and mortality. The lack of adequate early renal injury biomarkers is often a problem for an early AKI diagnosis. In recent years, numerous scientific studies have been carried out which reveal new urine and serum markers to assess the period of the kidney injury before revealing its late clinical effects. In most clinical settings, AKI is due to acute renal tubular necrosis which results in protein accumulation in urine. Determination of the concentrations of proteins such as NGAL (neutrophil gelatinase-associated lipocalin) and KIM-1 (kidney injury molecule-1) are of great significance in the diagnosis of AKI. Aim. The purpose of the study was to review the literature about significance of NGAL and KIM-1 proteins for diagnosis of acute kidney injury (AKI) in clinical practice. Materials and method. Analysis of Polish and foreign literature.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Identification of proteins associated with amyloidosis by polarity index method
Autorzy:
Polanco, Carlos
Samaniego, José
Uversky, Vladimir
Castañón-González, Jorge
Buhse, Thomas
Leopold-Sordo, Marili
Madero-Arteaga, Alejandro
Morales-Reyes, Alicia
Tavera-Sierra, Lourdes
González-Bernal, Jesus
Arias-Estrada, Miguel
Tematy:
Polarity index method
natively unfolded proteins
intrinsically disordered proteins
natively folded proteins
neurons
amyloidosis
amyloid
amyloidogenic protein
Pokaż więcej
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1039130.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
There is a natural protein form, insoluble and resistant to proteolysis, adopted by many proteins independently of their amino acid sequences via specific misfolding-aggregation process. This dynamic process occurs in parallel with or as an alternative to physiologic folding, generating toxic protein aggregates that are deposited and accumulated in various organs and tissues. These proteinaceous deposits typically represent bundles of β-sheet-enriched fibrillar species known as the amyloid fibrils that are responsible for serious pathological conditions, including but not limited to neurodegenerative diseases, grouped under the term amyloidoses. The proteins that might adopt this fibrillar conformation are some globular proteins and natively unfolded (or intrinsically disordered) proteins. Our work shows that intrinsically disordered and intrinsically ordered proteins can be reliably identified, discriminated, and differentiated by analyzing their polarity profiles generated using a computational tool known as the polarity index method (Polanco & Samaniego, 2009; Polanco et al., 2012; 2013; 2013a; 2014; 2014a; 2014b; 2014c; 2014d). We also show that proteins expressed in neurons can be differentiated from proteins in these two groups based on their polarity profiles, and also that this computational tool can be used to identify proteins associated with amyloidoses. The efficiency of the proposed method is high (i.e. 70%) as evidenced by the analysis of peptides and proteins in the APD2 database (2012), AVPpred database (2013), and CPPsite database (2013), the set of selective antibacterial peptides from del Rio et al. (2001), the sets of natively unfolded and natively folded proteins from Oldfield et al. (2005), the set of human revised proteins expressed in neurons, and non-human revised proteins expressed in neurons, from the Uniprot database (2014), and also the set of amyloidogenic proteins from the AmyPDB database (2014).
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Heparin- and Zn^2+-binding proteins from boar seminal plasma
Autorzy:
Hołody, Dariusz
Strzeżek, Jerzy
Tematy:
boar seminal plasma
heparin-binding proteins
Zn^{2+}-binding proteins
Pokaż więcej
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne
Powiązania:
https://bibliotekanauki.pl/articles/1044452.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
Opis:
Low molecular mass, heparin-binding proteins from seminal plasma play an important role in gametes interaction whereas plasmatic Zn^{2+}-binding proteins stabilize chromatin and plasmalemma structures and protect spermatozoa in the female reproductive tract. By means of affinity chromatography the heparin- and Zn^{2+}-binding proteins were isolated from boar seminal plasma and both preparations were analyzed by reverse HPLC. Most of the proteins bound to heparine and Zn^{2+}-ions were classified as spermadhesins. Three fractions binding exclusively Zn^{2+} were isolated. They differ in amino-acid composition, content of glucosamine and content of protein components revealed by SDS/PAGE.
Dostawca treści:
Biblioteka Nauki
Artykuł
Tytuł:
Zmiany w ekspresji : białka beta amyloidu (betaA), prekursora amyloidowego białka beta (beta-APP) oraz w strukturze i ufosforylowaniu białka tau, wywołane czynnikami zaburzającymi homeostazę komórki w mózgu osób chorych na chorobę Alzheimera, oraz w doświadczeniach in vivo i in vitro
Autorzy:
Gordon-Krajcer, Wanda
Wydawca:
Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej PAN
Opis:
Bibliogr. s. 24-37
Rozprawa obejmuje cykl publikacji
pag. varia : ryc. ; 30 cm
Dostawca treści:
RCIN - Repozytorium Cyfrowe Instytutów Naukowych
Książka
Tytuł:
Evaluating the fitness cost of protein expression in Saccharomyces cerevisiae
Autorzy:
Tomala, Katarzyna
Korona, Ryszard
Opis:
Protein metabolism is one of the most costly processes in the cell and is therefore expected to be under the effective control of natural selection. We stimulated yeast strains to overexpress each single gene product to approximately 1% of the total protein content. Consistent with previous reports, we found that excessive expression of proteins containing disordered or membrane-protruding regions resulted in an especially high fitness cost. We estimated these costs to be nearly twice as high as for other proteins. There was a ten-fold difference in cost if, instead of entire proteins, only the disordered or membrane-embedded regions were compared with other segments. Although the cost of processing bulk protein was measurable, it could not be explained by several tested protein features, including those linked to translational efficiency or intensity of physical interactions after maturation. It most likely included a number of individually indiscernible effects arising during protein synthesis, maturation, maintenance, (mal)functioning, and disposal. When scaled to the levels normally achieved by proteins in the cell, the fitness cost of dealing with one amino acid in a standard protein appears to be generally very low. Many single amino acid additions or deletions are likely to be neutral even if the effective population size is as large as that of the budding yeast. This should also apply to substitutions. Selection is much more likely to operate if point mutations affect protein structure by, for example, extending or creating stretches that tend to unfold or interact improperly with membranes.
Dostawca treści:
Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Artykuł

Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies