- Tytuł:
-
Analysis of secondary structure of protein in tissues using FT-IR.
Analiza struktur drugorzędowych białek w tkankach zwierzęcych za pomocą spektroskopii FT-IR. - Autorzy:
- Majzner, Katarzyna
- Opis:
-
Celem niniejszej pracy była próba zbudowania modelu matematycznego, służącego do przewidywania zawartości struktur drugorzędowych w białkach, opartego na pomiarach FT-IR. Model taki ma służyć znalezieniu korelacji pomiędzy zmianami strukturalnymi białek w tkankach zwierzęcych a zmianami wywołanymi chorobą cukrzycową. W tym celu zbudowano bazę widm białek referencyjnych o znanej budowie krystalograficznej i określonej strukturze drugorzędowej.Celem szczegółowym pracy było zebranie widm ok. 35 białek za pomocą dwóch technik mikrospektroskopii FT-IR (transrefleksja oraz ATR), aby następnie wykorzystać je do stworzenia bazy spektroskopowej. Zebrane w bazie białka miały znaną strukturę krystalograficzną, zatem uzyskane wyniki szacowania zawartości struktury drugorzędowej mogły być weryfikowane. Dzięki temu budowany model może jak najlepiej odzwierciedlać rzeczywistą zawartość struktur białkowych w badanych tkankach. Druga część pracy dotyczyła wykorzystania modelu zbudowanego w oparciu o zebrane w bazie widma do analizy tkanek zwierzęcych. Wykonano pomiary tkanek zdrowych oraz ze zmianami chorobowymi i podjęto próbę oszacowania udziału struktur a-helisy i b-kartki w materiałach biologicznych. Porównanie udziału wspomnianych struktur w analizowanych tkankach pozwala wyciągnąć wnioski na temat korelacji zmian chorobowych ze zmianami w profilu biochemicznym w tkankach.
The aim of this work was an attempt to build a mathematical model based on FT-IR measurements, which would be used in prediction of secondary structures content of proteins. The application of the model is to find a correlation between changes in protein structures in control and diabetic animal tissues. In order to achieve this a spectral database of proteins of known crystallography and therefore secondary structures was built. The precise aim was to measure FT-IR spectra of approximately 35 proteins by means of two FT-IR microscopic techniques (transreflection and ATR) to build the spectral database. The chosen proteins have solved crystallographic structures, which can be used to verify the contents predicted by the model. Therefore, the created model can properly reflect the actual protein structures content in studied tissues.The second part of the work was concerned with applying the model based on the spectral database to study the animal tissues. Control and diseased tissues were measured and later an attempt to predict the secondary structures contribution of a-helix and b-sheets in biological material. A comparison between the contribution of the structures mentioned above allows drawing conclusions about the correlation between diabetic lesions and biochemical profile of the tissues. - Dostawca treści:
- Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
Inne