Informacja

Drogi użytkowniku, aplikacja do prawidłowego działania wymaga obsługi JavaScript. Proszę włącz obsługę JavaScript w Twojej przeglądarce.

English (EN)·Polski (PL)·Yкраїнський (UK)
Przejdź do strony domowej biblioteki Pedagogiczna Biblioteka Wojewódzka im. Komisji Edukacji Narodowej w Lublinie Link otwiera się w nowym oknie Logo biblioteki Prolib Integro - strona głównaPedagogiczna Biblioteka Wojewódzka im. Komisji Edukacji Narodowej w Lublinie
Zmień bibliotekę

Wyszukujesz frazę "subtyping" wg kryterium: Temat

  Lista filtrów
Wyrównaj
    Wyświetlanie 1-5 z 5
    Tytuł:
    Variabilities in global DNA methylation and $\beta$-sheet richness establish spectroscopic landscapes among subtypes of pancreatic cancer
    Autorzy:
    Adamek, Dariusz
    Czaja, Michał
    Birarda, Giovanni
    Skirlińska-Nosek, Katarzyna
    Lipiec, Ewelina
    Piccirilli, Federica
    Vaccari, Lisa
    Szymoński, Krzysztof
    Chmura, Łukasz
    Wilkosz, Natalia
    Szymoński, Marek
    Seweryn, Sara
    Sofińska, Kamila
    Szpor, Joanna
    Opis:
    Purpose: Knowledge about pancreatic cancer (PC) biology has been growing rapidly in recent decades. Nevertheless, the survival of PC patients has not greatly improved. The development of a novel methodology suitable for deep investigation of the nature of PC tumors is of great importance. Molecular imaging techniques, such as Fourier transform infrared (FTIR) spectroscopy and Raman hyperspectral mapping (RHM) combined with advanced multivariate data analysis, were useful in studying the biochemical composition of PC tissue. Methods: Here, we evaluated the potential of molecular imaging in differentiating three groups of PC tumors, which originate from different precursor lesions. Specifically, we comprehensively investigated adenocarcinomas (ACs): conventional ductal AC, intraductal papillary mucinous carcinoma, and ampulla of Vater AC. FTIR microspectroscopy and RHM maps of 24 PC tissue slides were obtained, and comprehensive advanced statistical analyses, such as hierarchical clustering and nonnegative matrix factorization, were performed on a total of 211,355 Raman spectra. Additionally, we employed deep learning technology for the same task of PC subtyping to enable automation. The so-called convolutional neural network (CNN) was trained to recognize spectra specific to each PC group and then employed to generate CNN-prediction-based tissue maps. To identify the DNA methylation spectral markers, we used differently methylated, isolated DNA and compared the observed spectral differences with the results obtained from cellular nuclei regions of PC tissues. Results: The results showed significant differences among cancer tissues of the studied PC groups. The main findings are the varying content of β-sheet-rich proteins within the PC cells and alterations in the relative DNA methylation level. Our CNN model efficiently differentiated PC groups with 94% accuracy. The usage of CNN in the classification task did not require Raman spectral data preprocessing and eliminated the need for extensive knowledge of statistical methodologies. Conclusions: Molecular spectroscopy combined with CNN technology is a powerful tool for PC detection and subtyping. The molecular fingerprint of DNA methylation and β-sheet cytoplasmic proteins established by our results is different for the main PC groups and allowed the subtyping of pancreatic tumors, which can improve patient management and increase their survival. Our observations are of key importance in understanding the variability of PC and allow translation of the methodology into clinical practice by utilizing liquid biopsy testing.
    Dostawca treści:
    Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
    Artykuł
    Autorzy:
    Adamek, Dariusz
    Milian-Ciesielska, Katarzyna
    Szymoński, Krzysztof
    Lipiec, Ewelina
    Opis:
    Pancreatic cancer is a very aggressive and lethal malignant neoplasm with overall 5-year survival rates below 10%. The field of pancreatic cancer research is rapidly evolving. Reports of newly revealed pathomechanisms of the nature of these tumors are published daily. Nevertheless, many aspects of a pathologic evaluation are still uncertain. It is crucial to be able to pull out practical information that impacts the diagnostic process, called a pathologic evaluation. In this review, we comprehensively summarize some of the recent papers from the pathologists’ and clinicians’ points of view. We specifically focus on pathology assessment and reporting, to make them meaningful for clinical and research purposes. Lastly, we highlight novel diagnostic and research approaches, point out some missing pieces in the field, and suggest further study directions.
    Dostawca treści:
    Repozytorium Uniwersytetu Jagiellońskiego
    Artykuł
    Tytuł:
    Zaburzenia odżywiania – dylematy diagnozy
    Eating disorders – dilemmas of subtyping
    Autorzy:
    Pilecki, Maciej Wojciech
    Sałapa, Kinga
    Józefik, Barbara
    Tematy:
    subtyping
    anorexia
    data mining
    k-mean cluster analysis
    bulimia
    analiza skupień metodą k-średnich
    typy diagnoz
    eksploracja danych
    jadłowstręt
    Pokaż więcej
    Wydawca:
    Medical Communications
    Powiązania:
    https://bibliotekanauki.pl/articles/944624.pdf  Link otwiera się w nowym oknie
    Opis:
    The aim of this study was to present the dilemmas in the diagnosis of eating disorders on an example of division of a group of girls with diagnosed eating disorders on the basis of the self-assessment questionnaire results which provides an alternative to the clinical criteria. The study covered 116 girls diagnosed with any of the eating disorders according to DSM-IV consulted for the first time between 2002 and 2004 in the outpatient clinic of the Child and Adolescent Psychiatry Unit, University Hospital in Cracow, Poland. Due to statistical limitations of the model only dependent variables such as self-assessment of the presence of depressive symptoms (measured by Beck Depression Questionnaire, BDI), eating attitudes (measured using Eating Attitudes Test, EAT26), self-image (Social Self from Offer’s Self-Image Questionnaire, JaSpoł QSIA) and family relations (Intimacy scale from the Family of Origin Scale, INT FOS) were subjected to k-means cluster analysis. The conducted analyses led to the emergence of five clusters which did not correspond to the division into particular clinical diagnoses. All the clusters turned out to differ from one other in the context of the results of their constituent questionnaire scales. Cluster One proved to characterise individuals with self-assessed low severity of eating problems and depression and a favourable image of their social functioning and family relations. The interaction observed in Cluster Five was the opposite. The majority of the patients in Cluster One were diagnosed with restrictive anorexia, while in Cluster Five with bulimia. Cluster Three turned out to be most different from the others. Positive self-image and family relations were accompanied by high self-assessed severity of eating problems and low depression. The obtained results indicate that the clinical division of eating disorders proposed in ICD and DSM is not the only possible. Other ways of grouping patients may be of interest not only cognitively but may also have some clinical value.
    Celem badania było przedstawienie dylematów dotyczących diagnozy zaburzeń odżywiania się na przykładzie alternatywnego do kryteriów klinicznych podziału grupy dziewcząt z rozpoznaniem tych zaburzeń, uwzględniającego wyniki kwestionariuszy samooceny. Badaniem objęto 116 dziewcząt z rozpoznaniem któregoś z zaburzeń odżywiania się według DSM-IV, konsultowanych po raz pierwszy w latach 2002–2004 w ambulatorium Oddziału Klinicznego Psychiatrii Dzieci i Młodzieży Szpitala Uniwersyteckiego w Krakowie. Z uwagi na ograniczenia statystyczne modelu jedynie zmienne zależne, takie jak: samoocena obecności objawów depresyjnych (Kwestionariusz Depresji Becka, BDI), samoocena obecności problemów z odżywianiem się (Kwestionariusz Postaw wobec Odżywiania, EAT26), obraz siebie (Ja Społeczne Kwestionariusza Obrazu Siebie Offera, JaSpoł QSIA) i relacje rodzinne (skala Intymności Skali Rodziny Pochodzenia, INT FOS), zostały poddane analizie skupień metodą k-średnich. Przeprowadzone analizy doprowadziły do wyłonienia pięciu skupień niepokrywających się z podziałem na poszczególne diagnozy kliniczne. Wszystkie skupienia różnią się wynikami tworzących je skal kwestionariuszowych. Pierwsze skupienie okazało się charakteryzować osoby o niskim w swojej ocenie nasileniu występowania problemów z odżywianiem się i depresyjności oraz korzystnym obrazie swojego funkcjonowania społecznego i relacji rodzinnych. Zależność obserwowana w skupieniu 5. była odwrotna. Przeważająca liczba pacjentek w skupieniu 1. miała rozpoznaną anoreksję restrykcyjną, a w skupieniu 5. bulimię. Najbardziej odmienne od pozostałych okazało się skupienie 3. Pozytywnemu obrazowi siebie, relacji rodzinnych w badanych obszarach towarzyszyło duże nasilenie występowania problemów z odżywianiem się i niskie depresyjności w samoocenie. Otrzymane wyniki wskazują, iż podział kliniczny zaburzeń odżywania się proponowany w ICD i DSM nie jest jedynym możliwym. Inne sposoby porządkowania pacjentów nie tylko mogą być interesujące poznawczo, ale też mają pewną wartość kliniczną.
    Dostawca treści:
    Biblioteka Nauki
    Artykuł
      Wyświetlanie 1-5 z 5

      Ta witryna wykorzystuje pliki cookies do przechowywania informacji na Twoim komputerze. Pliki cookies stosujemy w celu świadczenia usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany ustawień dotyczących cookies oznacza, że będą one zamieszczane w Twoim komputerze. W każdym momencie możesz dokonać zmiany ustawień dotyczących cookies